More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0910 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 501 aa  1003    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  54.17 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  49.7 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  48.6 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  49.2 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  46.32 
 
 		 497 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 530 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.19 
 
 		 519 aa  226  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 518 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.45 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  31.14 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.33 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 500 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  31.14 
 
 		 500 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 520 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 519 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  31.14 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 526 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 491 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 523 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 519 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  31.14 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  31.14 
 
 		 500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.64 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 513 aa  213  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  36.39 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  31.12 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.55 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.18 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  30.87 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 		 497 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 489 aa  211  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.91 
 
 		 482 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.91 
 
 		 481 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 482 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.05 
 
 		 526 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.5 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.5 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 481 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  31.24 
 
 		 522 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 		 530 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 494 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.53 
 
 		 525 aa  203  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.52 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 515 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 501 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  32.24 
 
 		 516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.54 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 502 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 524 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 506 aa  200  5e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31 
 
 		 481 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 525 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 1043 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.36 
 
 		 518 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 770 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.65 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 512 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.5 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.61 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 516 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.77 
 
 		 522 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  30.58 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 502 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.57 
 
 		 565 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>