More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1198 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1198  ABC transporter related  100 
 
 		 556 aa  1095    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0109647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1003  ABC transporter related  39.74 
 
 		 565 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.16 
 
 		 602 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.93 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.16 
 
 		 579 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  28.42 
 
 		 571 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  29.55 
 
 		 582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.76 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.65 
 
 		 586 aa  286  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.88 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.38 
 
 		 585 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0580  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.45 
 
 		 571 aa  279  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  30.2 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  31.84 
 
 		 572 aa  277  4e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  32.85 
 
 		 580 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  32.85 
 
 		 580 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  28.94 
 
 		 618 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  27.14 
 
 		 571 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.8 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1207  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA  32.49 
 
 		 580 aa  269  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.272032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.45 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1055  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.1 
 
 		 580 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0964  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.09 
 
 		 601 aa  266  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.519828  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.94 
 
 		 588 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.28 
 
 		 580 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.76 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.42 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  30.68 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  28.39 
 
 		 589 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.93 
 
 		 586 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0629  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  33.46 
 
 		 587 aa  260  4e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.75 
 
 		 586 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.93 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  31.53 
 
 		 586 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.39 
 
 		 597 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.77 
 
 		 575 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.73 
 
 		 583 aa  257  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  29.15 
 
 		 598 aa  256  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  28.81 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.23 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  32.84 
 
 		 566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.21 
 
 		 586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.04 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0117  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.02 
 
 		 574 aa  254  3e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  31.44 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.25 
 
 		 578 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 586 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.99 
 
 		 579 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.25 
 
 		 578 aa  253  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.67 
 
 		 578 aa  253  7e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.04 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1529  ABC transporter related  30.87 
 
 		 568 aa  253  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000802446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  28.95 
 
 		 611 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  27.86 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.62 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.86 
 
 		 586 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.5 
 
 		 1000 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.71 
 
 		 582 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.41 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  32.91 
 
 		 612 aa  250  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.62 
 
 		 598 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  30.09 
 
 		 586 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.62 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.49 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.49 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.49 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  31.75 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  28.38 
 
 		 611 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  31.01 
 
 		 598 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 598 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.01 
 
 		 598 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.01 
 
 		 598 aa  246  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.16 
 
 		 587 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.17 
 
 		 581 aa  245  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.38 
 
 		 611 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.81 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  31.1 
 
 		 581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.19 
 
 		 976 aa  243  7e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.58 
 
 		 597 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.85 
 
 		 592 aa  243  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  28.78 
 
 		 614 aa  243  9e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.12 
 
 		 594 aa  242  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  31.83 
 
 		 738 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 566 aa  242  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.63 
 
 		 582 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  28.37 
 
 		 627 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.62 
 
 		 581 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 598 aa  242  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  30.02 
 
 		 611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  29.7 
 
 		 614 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.12 
 
 		 971 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.63 
 
 		 582 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.06 
 
 		 601 aa  239  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  28.73 
 
 		 582 aa  239  8e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.64 
 
 		 598 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.24 
 
 		 582 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  28.37 
 
 		 975 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>