More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3314 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3416  ABC transporter ATP-binding protein  99.11 
 
 		 225 aa  456  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3314  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 225 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3247  ABC transporter ATP-binding protein  98.67 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3236  ABC transporter, ATP-binding protein  99.11 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.595033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3311  ABC transporter ATP-binding protein  98.46 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4228  ABC transporter, ATP-binding protein  78.22 
 
 		 225 aa  362  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3356  ABC transporter, ATP-binding protein  78.22 
 
 		 225 aa  362  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3261  ABC transporter, ATP-binding protein  77.78 
 
 		 225 aa  360  9e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.770994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3068  ABC transporter, ATP-binding protein  76.89 
 
 		 227 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769367  normal  0.0295076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1256  ABC transporter related  36.46 
 
 		 288 aa  131  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000452094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  36.32 
 
 		 568 aa  124  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  36.95 
 
 		 582 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  36.27 
 
 		 571 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  33 
 
 		 574 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  38.14 
 
 		 553 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  37.91 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0714  ABC transporter related  34.4 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0335  ABC transporter related  32.87 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0378349 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.85 
 
 		 627 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.16 
 
 		 272 aa  108  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  32.58 
 
 		 605 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2689  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 530 aa  107  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2320  ABC transporter related  35 
 
 		 514 aa  106  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12820  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.29 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 234 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.73 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.19 
 
 		 574 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.7 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  40.72 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.96 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 		 274 aa  101  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07510  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.06 
 
 		 495 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  37.97 
 
 		 530 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8788  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.57 
 
 		 550 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1544  ABC transporter related  30.45 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.64 
 
 		 277 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.81 
 
 		 593 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.81 
 
 		 280 aa  99  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1033  ABC transporter related  34.07 
 
 		 512 aa  99  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.264472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  34.22 
 
 		 497 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  31.58 
 
 		 272 aa  98.6  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.31 
 
 		 276 aa  98.2  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.63 
 
 		 562 aa  98.2  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 518 aa  98.2  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 568 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.63 
 
 		 279 aa  97.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 300 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 300 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 300 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 		 630 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  30.89 
 
 		 641 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 299 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.78 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  34.69 
 
 		 273 aa  96.3  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  31.53 
 
 		 269 aa  95.9  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.46 
 
 		 277 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  33.79 
 
 		 526 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.9 
 
 		 284 aa  95.9  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.41 
 
 		 280 aa  95.5  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.49 
 
 		 276 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.8 
 
 		 277 aa  95.1  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.94 
 
 		 280 aa  94.7  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  42.36 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  33.51 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1924  ABC transporter related  37.36 
 
 		 353 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405709 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  30.77 
 
 		 571 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 470 aa  93.6  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  41.18 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.81 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  32.58 
 
 		 581 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  28.38 
 
 		 568 aa  92.4  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  35.71 
 
 		 289 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  35.5 
 
 		 564 aa  92  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1131  ABC transporter related  42.36 
 
 		 570 aa  92  7e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.844878  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.85 
 
 		 279 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 770 aa  92  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1434  ABC transporter related  34.39 
 
 		 516 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305942  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0231  ABC transporter related  34.39 
 
 		 531 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  36.46 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.52 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0252  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 541 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.062199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.67 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  40.58 
 
 		 548 aa  90.9  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 249 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1489  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  27.98 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.154278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.04 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  37.13 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1662  ABC transporter related  31.19 
 
 		 460 aa  89.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>