194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0408 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  100 
 
 		 109 aa  216  7e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  61.11 
 
 		 111 aa  140  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0129  ribonuclease P  57.55 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  52.73 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  52.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  52.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  52.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  52.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  52.73 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  52.73 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  54.13 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  52.73 
 
 		 115 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  50.91 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  50.91 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  53.15 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1897  ribonuclease P  52.68 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.53987e-16  hitchhiker  4.71177e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  50.91 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  51.4 
 
 		 115 aa  103  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  54.08 
 
 		 116 aa  100  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  49.53 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  49.53 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2064  ribonuclease P  45.95 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0143582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  36.04 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  40.57 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  37 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  32.11 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2198  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000952989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1738  ribonuclease P protein component  35.85 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1863  RNase P protein component  35.4 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.546361  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2934  ribonuclease P protein component  34.55 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682  ribonuclease P protein component  44.44 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  33.03 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3945  ribonuclease P  35.58 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1629  ribonuclease P protein component  37.04 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.315219  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0121  ribonuclease P protein component  37.27 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.406927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2413  ribonuclease P  35.58 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  34.34 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4369  ribonuclease P protein component  34.31 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.126994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1040  ribonuclease P protein component  33.94 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  37.65 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  28.04 
 
 		 114 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3490  ribonuclease P  38.1 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000922016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4431  ribonuclease P  36.36 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3759  ribonuclease P protein component  35.58 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2237  ribonuclease P protein component  32.65 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2996  ribonuclease P  34.55 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000822394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2673  ribonuclease P  34.55 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00724132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0552  ribonuclease P protein component  34.69 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1331  ribonuclease P protein component  33.67 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3625  ribonuclease P protein component  29.91 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.284043  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0983  ribonuclease P protein component  33.65 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.162194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  41.67 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0821  ribonuclease P protein component  32.69 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2151  ribonuclease P protein component  32.41 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  38.89 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2762  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000158886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  32 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1040  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0513155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2369  ribonuclease P  31.43 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000213724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4044  ribonuclease P protein component  31.03 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0004  ribonuclease P  33.33 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00123584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  36.47 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  31.73 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5267  ribonuclease P  27.56 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.115584  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  31.76 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  30.91 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  28.44 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1355  ribonuclease P protein component  31.91 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00991852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4155  ribonuclease P  32.32 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.58759e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4266  ribonuclease P  32.32 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000515429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0641  ribonuclease P protein component  31.37 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4137  ribonuclease P protein component  30.3 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0213874  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0552  ribonuclease P protein component  35.8 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  33.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  34.12 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4248  ribonuclease P  33.7 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000157593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  28.24 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  30.23 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf882  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2883  ribonuclease P protein component  29.47 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0117467  normal  0.419637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3123  ribonuclease P protein component  28.85 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000870513  hitchhiker  0.0000000610775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03587  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.201936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4497  ribonuclease P protein component  30.59 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3088  ribonuclease P protein  27.88 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  33.87 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3917  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000273614  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135  ribonuclease P  32.63 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000166605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4068  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000599062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0030  ribonuclease P  30.3 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00687472  normal  0.199191 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4125  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00333224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0011  ribonuclease P  32.26 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000676804  hitchhiker  0.000546181 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4214  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000396678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4151  ribonuclease P protein component  32.61 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4071  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00679811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4053  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000316737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4221  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4232  ribonuclease P  31.31 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000722418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>