More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2575 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
339 aa  634    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1238  glycosyl transferase group 1  46.45 
 
 
349 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  32.05 
 
 
356 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3664  glycosyl transferase, group 1  33.92 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.032207  normal  0.177473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
349 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
381 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
347 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
344 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
355 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4362  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 
349 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
639 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
360 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4162  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
347 aa  99  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0349192  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
343 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0542  glycosyl transferase group 1  43.37 
 
 
351 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 
369 aa  93.2  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  36.7 
 
 
418 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
350 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
303 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
387 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 
387 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
420 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
434 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
395 aa  87  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4785  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195851  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2455  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  36.47 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 
748 aa  83.2  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  35.79 
 
 
392 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4402  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.87 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.87 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.82 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.03 
 
 
407 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
457 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
358 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  33.33 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
452 aa  76.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  27.27 
 
 
420 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.36 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.53 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  37.84 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  21.71 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>