More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2111 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2111  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 403 aa  791    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0697  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.03 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1999  alcohol dehydrogenase  45.93 
 
 		 395 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0396672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2206  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.6 
 
 		 405 aa  306  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4169  alcohol dehydrogenase  46.76 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.235444  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.8 
 
 		 400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.115342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2251  alcohol dehydrogenase  40.35 
 
 		 415 aa  252  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1324  alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0902  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.54 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.164909  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0483  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  39.95 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.938147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2277  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.37 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.00000000419237  hitchhiker  0.000159352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  28.07 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  34.18 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  28.18 
 
 		 343 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.98 
 
 		 344 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.53 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  29.81 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.81 
 
 		 354 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.91 
 
 		 340 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1933  putative dehydrogenase  30.16 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2813  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0594163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.3 
 
 		 342 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2786  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.51 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2636  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.23 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2830  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.782331  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41760  2,3-butanediol dehydrogenase  30.89 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0108  alcohol dehydrogenase  32.05 
 
 		 338 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.476377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.72 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1092  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.15 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2793  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.79 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.05 
 
 		 350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3010  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.65 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.09 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1653  starvation sensing protein RspB  30.74 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00258422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4454  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.42 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  30.65 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1787  putative dehydrogenase  30.29 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.496797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1617  putative dehydrogenase  28.38 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.31 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1676  putative dehydrogenase  28.38 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1608  putative dehydrogenase  28.38 
 
 		 339 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1666  putative dehydrogenase  28.38 
 
 		 339 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.747821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2050  putative dehydrogenase  30.62 
 
 		 339 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0249357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01549  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  30.62 
 
 		 339 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0963058  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2063  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.62 
 
 		 339 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00265684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01539  hypothetical protein  30.62 
 
 		 339 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.161589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  30.65 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1620  putative dehydrogenase  30.29 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00863317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  32.17 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.59 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  29.6 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2473  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.05 
 
 		 344 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  normal  0.0147407 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  28.4 
 
 		 348 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.01 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2119  dehydrogenase starvation-sensing protein  28.02 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  28.3 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0807  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0463124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.6 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.2 
 
 		 352 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3230  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.08 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.282549  normal  0.671349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 		 344 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1007  alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  27.59 
 
 		 351 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4598  putative dehydrogenase  29.43 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.43 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  27.18 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0286  alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425659  normal  0.323725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  30.87 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.27 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.76 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.33 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28190  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  30.73 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.99 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.72 
 
 		 335 aa  107  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  28.69 
 
 		 351 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  29.65 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.19 
 
 		 346 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.51 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01050  sorbitol dehydrogenase, putative  28.39 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.917438  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09064  hypothetical protein similar to xylitol dehydrogenase (Broad)  27.33 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.715081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.25 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1915  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.75 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.482777  normal  0.264492 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5131  putative dehydrogenase  29.11 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.869856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4159  alcohol dehydrogenase  28.29 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.44287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  27.6 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  26.34 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2864  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.95 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  26.34 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  26.34 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>