More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0836 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  820    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  49.21 
 
 		 384 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  48.42 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  45.69 
 
 		 386 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  48.16 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  46.07 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  47.89 
 
 		 384 aa  346  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.39 
 
 		 383 aa  346  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  44.44 
 
 		 379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  47.4 
 
 		 383 aa  342  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  45.83 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  43.19 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  46.05 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  42.67 
 
 		 380 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  44.7 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  44.27 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  45.48 
 
 		 362 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  45.21 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  43.7 
 
 		 385 aa  312  7.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  44.44 
 
 		 363 aa  312  9e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  44.09 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  41.69 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  45.21 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.64 
 
 		 388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  41.32 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  43.23 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  41.21 
 
 		 379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  41.16 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  41.58 
 
 		 380 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.21 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  39.37 
 
 		 382 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.5 
 
 		 383 aa  295  8e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  39.37 
 
 		 382 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  42.7 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.7 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  39.11 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  44.02 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  37.66 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  43.11 
 
 		 397 aa  292  9e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  37.66 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  40.38 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.11 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  39.48 
 
 		 385 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  41.93 
 
 		 382 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.05 
 
 		 382 aa  286  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  43.05 
 
 		 382 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.6 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  40.38 
 
 		 395 aa  272  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  39.42 
 
 		 387 aa  272  9e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  40.66 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  38.83 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  39.75 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  37.97 
 
 		 406 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  40.38 
 
 		 394 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  37.63 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  37.56 
 
 		 396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  37.37 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  37.8 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  38.08 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  38.5 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  37.31 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  37.05 
 
 		 417 aa  249  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  38.05 
 
 		 399 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  39.52 
 
 		 421 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.8 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  36.79 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.08 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  36.96 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  36.88 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  37.95 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  38.19 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  37.64 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  37.47 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  36.36 
 
 		 422 aa  239  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  36.96 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  35.1 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  36.76 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.36 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  36.53 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  37.56 
 
 		 402 aa  236  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  36.34 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  36.87 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  37.43 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  36.2 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  38.18 
 
 		 400 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  34.02 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  36.77 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  38.26 
 
 		 381 aa  230  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.11 
 
 		 413 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  37.4 
 
 		 387 aa  229  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  35.23 
 
 		 374 aa  227  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  38.38 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  37.83 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>