138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4024 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  214  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0900  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 124 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.825197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2730  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 124 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777363  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4786  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 124 aa  83.6  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0726  transposase IS3/IS911 family protein  48.19 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0709  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.668336  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  47.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  47.3 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  43.21 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  50.82 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8238  transposase  47.95 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  51.79 
 
 		 146 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  41.56 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  44.87 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  44.87 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0786  transposase IS3/IS911 family protein  39.05 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  38.82 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  45.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  45.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0183  IS3/IS911 family transposase  44.44 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  45.76 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5516  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6366  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1220  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40108  normal  0.0481139 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  48.39 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  50 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0139  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  43.1 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1225  IS3/IS911 family transposase  41.89 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.54899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  45.28 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  39.71 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  39.71 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  39.71 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  42.25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  46 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  40 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  42.25 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  41.07 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  44.23 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5013  transposase IS3/IS911 family protein  31.07 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0935  transposase IS3/IS911 family protein  39.71 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.089943  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3504  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138745  normal  0.543824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  38.24 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5410  transposase IS3/IS911 family protein  30.61 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.650569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  36.76 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  50 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3012  transposase  38.24 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2742  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4326  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4619  transposase IS3/IS911 family protein  35.8 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4688  transposase IS3/IS911 family protein  35.9 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426446  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9620  hypothetical protein  39.13 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.754847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1965  transposase IS3/IS911  39.47 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  42 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  43.64 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4842  transposase IS3/IS911 family protein  30.1 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.926413  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  34.29 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 135 aa  43.5  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3726  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  35.29 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0686  transposase  39.02 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7043  transposase  39.02 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.443559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  42.31 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3198  transposase IS3/IS911 family protein  42.19 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3409  hypothetical protein  39.02 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0779  hypothetical protein  55.32 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2724  transposase IS3/IS911 family protein  37.93 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2252  transposase IS3/IS911 family protein  29.13 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367013  normal  0.015617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  57.5 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  30.3 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  30.3 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  30.3 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>