More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3983 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  60.8 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  61.31 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  56.52 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  58.29 
 
 		 205 aa  227  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  57.49 
 
 		 208 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  37.62 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  40.11 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  42.2 
 
 		 121 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  39.45 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  40.38 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  29.65 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  28.99 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.55 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  29.44 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  29.79 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  35 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  35 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  35 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.88 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 341 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 328 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  38.61 
 
 		 327 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  29.46 
 
 		 658 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  40 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.05 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.75 
 
 		 260 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.16 
 
 		 325 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  28.67 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.79 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 320 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.7 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.46 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.5 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 		 286 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  37 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.05 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  23.38 
 
 		 315 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  35.35 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  35.35 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.67 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  28.1 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  32.28 
 
 		 408 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.61 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  33 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.31 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 324 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 266 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.94 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 		 253 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 274 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>