More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4435 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 155 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  73.51 
 
 		 165 aa  217  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  39.87 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  43.8 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  46.27 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  46.27 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  29.53 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1449  signal transduction protein  39.67 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0026  CBS domain-containing protein  34.17 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2856  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 		 620 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  44.66 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1420  CBS domain containing protein  30.65 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.2 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  35 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  32.64 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  32.52 
 
 		 625 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  33.06 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2012  CBS domain-containing protein  43.69 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  34.06 
 
 		 615 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0022  signal-transduction protein  29.75 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3107  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0515224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1576  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 620 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132625 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  30.67 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1515  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1582  cyclic nucleotide-binding protein  33.1 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0380043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  34.06 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6352  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  30.2 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  34.06 
 
 		 615 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5621  CBS domain-containing protein  39.17 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0984367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  37.5 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 615 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1637  CBS domain-containing protein  39.86 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.200106 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  37.07 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08210  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 139 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0631  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1358  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.43 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6471  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  36.67 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0797  CBS domain protein  37.5 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65672e-35 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  30.88 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  35.83 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  31.78 
 
 		 637 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  26.17 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7015  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6060  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.613406  normal  0.175834 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  34.45 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5465  CBS domain-containing protein  36.73 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  37.3 
 
 		 605 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0687  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  35.54 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  33.78 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0720  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000162258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  32.28 
 
 		 626 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.43 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0791  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  30.95 
 
 		 627 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  33.33 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  29.69 
 
 		 626 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0837  cyclic nucleotide-binding protein  33.81 
 
 		 629 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  36.3 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.83 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3932  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 623 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177243  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 		 286 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  36.13 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0528  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 611 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.766846  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 291 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  33.88 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  37.19 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3139  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533561  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1360  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.565308  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  28.77 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3985  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  35.54 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5973  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.643427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4382  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0262346  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.5 
 
 		 614 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>