More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3552 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3552  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 236 aa  461  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3228  two component transcriptional regulator, winged helix family  97.88 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  72.34 
 
 		 234 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  71.49 
 
 		 234 aa  321  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2924  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1619  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0208  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2983  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3339  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3386  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4078  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0729773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4004  DNA-binding response regulator  65.37 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0075  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0093  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3256  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2980  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0066  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0074  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.948307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0075  two component transcriptional regulator  64.5 
 
 		 230 aa  288  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3057  two component transcriptional regulator  64.94 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0008  two component transcriptional regulator  65.37 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3924  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.37 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.79 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  48.09 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.48 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  47.9 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  47.26 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 282 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 282 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 242 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 260 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  47.64 
 
 		 291 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 220 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3337  two component response regulator  44.83 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  47.64 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  47.21 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  46.64 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1091  two component transcriptional regulator  43.7 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  46.35 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 224 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.46 
 
 		 229 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1802  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1354  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.92 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  45.53 
 
 		 223 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1697  two component transcriptional regulator  43.57 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0568357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3332  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.17 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.65 
 
 		 279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 223 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.39 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3802  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711494  normal  0.282515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>