46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0309 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  95.54 
 
 		 224 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  71.29 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  70.83 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  67.76 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  68.75 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  68.72 
 
 		 345 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  68.72 
 
 		 217 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  50 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  43.14 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  37 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  48.28 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  43.85 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  33.96 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  40.3 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  25.23 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  25.23 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  29.92 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  32.54 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  30.4 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  34.02 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  34.55 
 
 		 183 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  28.93 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03736  ketosynthase  30.53 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  52  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  33.71 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  32.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3687  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.491511 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4764  hypothetical protein  34.55 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.222438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  31.73 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  27.27 
 
 		 193 aa  48.5  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2101  membrane protein  31.31 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.735256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0930  hypothetical protein  31.73 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3061  hypothetical protein  32.29 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458939  normal  0.850708 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  31.76 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3381  hypothetical protein  29.58 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1490  hypothetical protein  30.39 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  30.21 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  29.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0323  hypothetical protein  27.43 
 
 		 182 aa  41.6  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3513  hypothetical protein  26.81 
 
 		 182 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.380842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2175  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.76 
 
 		 181 aa  41.6  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.642064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>