More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5295 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  84.35 
 
 		 428 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  83.53 
 
 		 434 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  837    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  76.47 
 
 		 436 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 448 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 432 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  42.32 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.67 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 432 aa  289  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 431 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  40.88 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 440 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 474 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 431 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  27.29 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  28.9 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.8 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.8 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.8 
 
 		 432 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  26.17 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  27.27 
 
 		 447 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 442 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.34 
 
 		 448 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  25.18 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.94 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 446 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.87 
 
 		 449 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  26.17 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  26.17 
 
 		 485 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  24.21 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  24.21 
 
 		 445 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  24.21 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 422 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 463 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 463 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  26.13 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  23.77 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25.59 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  26.07 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.48 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  25.24 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  26.97 
 
 		 453 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  26 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.63 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.18 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  26 
 
 		 455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  22.64 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.57 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  27.23 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 436 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  23.56 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  22.57 
 
 		 429 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  25.93 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>