147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2446 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  100 
 
 
404 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  36.7 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  32.37 
 
 
383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  33.73 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  35.44 
 
 
371 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  32.46 
 
 
349 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  30 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  29.29 
 
 
366 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  26.97 
 
 
383 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  31.31 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  27.32 
 
 
392 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  29.82 
 
 
371 aa  98.2  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  26.98 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  32.48 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  30.15 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  30 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  26.59 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  27.48 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  30.92 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  29.04 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  27.08 
 
 
378 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  31.25 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  25.52 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  30.47 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  28.92 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  28.92 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  28.92 
 
 
407 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  25.71 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  28.06 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.21 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  32.15 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  29.59 
 
 
404 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  25.46 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  25.46 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  29.74 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.99 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  35.1 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  29.66 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  27.65 
 
 
394 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.22 
 
 
354 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  27.97 
 
 
372 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  30.21 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  25.44 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  27.25 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  27.83 
 
 
330 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  41.98 
 
 
358 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  27.22 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  44.79 
 
 
342 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  25.88 
 
 
396 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0593  acyltransferase 3  26.09 
 
 
339 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.4 
 
 
660 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  33.73 
 
 
358 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.17 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  25.57 
 
 
667 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.88 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  28.4 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  29.48 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  28.39 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  28.57 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  42.5 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  39.53 
 
 
382 aa  56.6  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  25.53 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  28.17 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.81 
 
 
638 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  24.89 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  28.75 
 
 
346 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  28.75 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.68 
 
 
350 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.4 
 
 
660 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  26.38 
 
 
377 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1939  acyltransferase 3  22.59 
 
 
341 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.1 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  40.96 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  26.83 
 
 
679 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  27.08 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.82 
 
 
635 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  29.38 
 
 
369 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  25.83 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  28.48 
 
 
370 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  28.69 
 
 
353 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  27.44 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  31.96 
 
 
398 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  26.55 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  23.88 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  26.63 
 
 
359 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  30.77 
 
 
378 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.91 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.92 
 
 
637 aa  50.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  24.32 
 
 
377 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  21.27 
 
 
615 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  23.84 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.8 
 
 
658 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  35 
 
 
684 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  28.22 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  27.3 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  28.22 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  25.78 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  27.23 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.69 
 
 
660 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  28.53 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>