191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4278 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4278  methyltransferase type 11  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150732 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0941  methyltransferase type 11  72.18 
 
 		 287 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.72 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  28.29 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 1012 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01774  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.95 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.441761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  32.88 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47892  predicted protein  26.26 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48704  predicted protein  25.09 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.51 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  28.69 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  27.1 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.41 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 268 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  24.52 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 362 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6936  putative cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32 
 
 		 343 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389274  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1840  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.11 
 
 		 345 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000670431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2318  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  26.24 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.300919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  22.5 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.29 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  31.37 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  24.53 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  33.61 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38159  predicted protein  23.44 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  27.56 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2026  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  31.3 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0234  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.86 
 
 		 420 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.950577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 261 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  23.32 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  27.63 
 
 		 376 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48517  predicted protein  26.92 
 
 		 403 aa  49.3  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  28.43 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  27.78 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 194 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  25 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4606  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.35 
 
 		 442 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  hitchhiker  0.0000312822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  29.31 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  26.88 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1388  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.76 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.420857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3339  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.99 
 
 		 428 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 275 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  21.52 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4335  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.7 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.139939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 226 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.3 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  32 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2906  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.29 
 
 		 409 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4840  methyltransferase type 11  31 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531482  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.47 
 
 		 201 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.04 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  24.27 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  31.62 
 
 		 363 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.83 
 
 		 264 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.29 
 
 		 251 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1858  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.47 
 
 		 383 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1752  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  26.47 
 
 		 383 aa  45.8  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000168259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  30.3 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.3 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  30.3 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  24.81 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  26.71 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>