139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3979 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  100 
 
 		 500 aa  1021    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  78.56 
 
 		 453 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.23 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.45 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.55 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.98 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.37 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  36.69 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  38.46 
 
 		 283 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  32.61 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  35.82 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  32.62 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  38.93 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.45 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  34.65 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  38.35 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  30.22 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  36.57 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.64 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  30.73 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.68 
 
 		 638 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.93 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  33.11 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  31.94 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  31.14 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.98 
 
 		 405 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  31.41 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  34.83 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  28.77 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  31.28 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.3 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  31.06 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 		 688 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  31.4 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.76 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  34.25 
 
 		 601 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  35.33 
 
 		 601 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.76 
 
 		 597 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  31.82 
 
 		 642 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  30 
 
 		 722 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.52 
 
 		 382 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  32.21 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  32.71 
 
 		 388 aa  53.9  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  27.72 
 
 		 237 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.52 
 
 		 382 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1411  hypothetical protein  34.13 
 
 		 886 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  32.52 
 
 		 382 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  22.51 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  32.5 
 
 		 801 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  33.12 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  34.88 
 
 		 235 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  31.79 
 
 		 345 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  30.97 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  29.8 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  32.05 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  34.38 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.55 
 
 		 376 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.42 
 
 		 506 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  33.67 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.67 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  30.46 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  38.94 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  31.2 
 
 		 249 aa  51.2  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  33.67 
 
 		 375 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.11 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  29.44 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  33.08 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  32.61 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  31.87 
 
 		 803 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 		 384 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.27 
 
 		 378 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  37.65 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1797  murein peptide amidase A  26.11 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.55 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  35.78 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.89 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1805  murein peptide amidase A  28.12 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.561164  normal  0.438296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.55 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1970  murein peptide amidase A  26.15 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.996708  normal  0.386863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  27.22 
 
 		 804 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01303  murein peptide amidase A  26.15 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2320  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.15 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.250489  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  51.22 
 
 		 241 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01314  hypothetical protein  26.15 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.107648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  28.48 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1442  murein peptide amidase A  26.15 
 
 		 262 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.79 
 
 		 218 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0129  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.34 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.846597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1652  murein peptide amidase A  27.6 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  0.0125995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1704  hypothetical protein  30.16 
 
 		 886 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.298194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.61 
 
 		 355 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1804  murein peptide amidase A  27.6 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000928134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.73 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1470  murein peptide amidase A  27.6 
 
 		 242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1558  murein peptide amidase A  26.8 
 
 		 262 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  35 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>