109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2852 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  98.61 
 
 		 574 aa  1126    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  100 
 
 		 574 aa  1145    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  30.11 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0396  hypothetical protein  30.09 
 
 		 557 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.059615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1148  hypothetical protein  31.43 
 
 		 556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  25.1 
 
 		 538 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  25.22 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  25.22 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  21.6 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  21.6 
 
 		 531 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  24.42 
 
 		 539 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  21.3 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  21.3 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  21.3 
 
 		 560 aa  74.7  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  24.25 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  24.25 
 
 		 539 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  23.91 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  23.91 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  23.91 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  21.22 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  21.22 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  21.5 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  21.5 
 
 		 560 aa  73.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  21.22 
 
 		 536 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  21.1 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  24.14 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  24.58 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  24.58 
 
 		 537 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  21.67 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  21.67 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  22.99 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  20.89 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  34.51 
 
 		 642 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  25.47 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  22.84 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  22.84 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  22.84 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  22.84 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  22.84 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  22.78 
 
 		 552 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  22.01 
 
 		 541 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  22.28 
 
 		 596 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  22.25 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  30.91 
 
 		 547 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  30.91 
 
 		 548 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  21.46 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  21.83 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  21.83 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  21.83 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  21.83 
 
 		 552 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  30.91 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  21.83 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  23.81 
 
 		 400 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  28.24 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  28.24 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  28.24 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  28.24 
 
 		 538 aa  51.6  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.03 
 
 		 596 aa  51.6  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 		 596 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  30 
 
 		 559 aa  50.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  38.82 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  38.82 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  38.82 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  21.18 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  21.18 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  21.67 
 
 		 552 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  25.07 
 
 		 563 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  25.07 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  24.79 
 
 		 487 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  25 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  25 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  25 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  25 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  25 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  23.96 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0459  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0574  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0579  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1758  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5357  transposase, IS4 family protein  27.94 
 
 		 545 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  27.52 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  27.52 
 
 		 532 aa  45.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>