137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2940 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  99.25 
 
 
536 aa  1096    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  99.78 
 
 
462 aa  949    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  87.84 
 
 
374 aa  698    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1106    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  99.25 
 
 
536 aa  1096    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  50.19 
 
 
534 aa  557  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  50.38 
 
 
534 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  50.38 
 
 
534 aa  558  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  48.22 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  48.67 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  48.67 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  48.67 
 
 
539 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  48.01 
 
 
531 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  48.01 
 
 
531 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  44.38 
 
 
534 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  49.29 
 
 
507 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  49.4 
 
 
417 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  93.81 
 
 
272 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  35.33 
 
 
544 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  35.33 
 
 
544 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  36.43 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  33.82 
 
 
537 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  46.67 
 
 
400 aa  225  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  29.4 
 
 
560 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  29.4 
 
 
560 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  29.4 
 
 
560 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  29.53 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  30.02 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  29.53 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  26.44 
 
 
552 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  26.44 
 
 
552 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  25 
 
 
552 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  25 
 
 
552 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  25 
 
 
552 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  25 
 
 
552 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  25 
 
 
552 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  25.7 
 
 
552 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  25.7 
 
 
552 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  25.7 
 
 
552 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  25.7 
 
 
552 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  25.7 
 
 
552 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  24.81 
 
 
552 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  25 
 
 
552 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  24.81 
 
 
552 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  24.81 
 
 
552 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  24.81 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  24.63 
 
 
552 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2828  hypothetical protein  97.56 
 
 
101 aa  161  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0550197  normal  0.193636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  27.03 
 
 
560 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  33.04 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  22.99 
 
 
572 aa  97.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  22.99 
 
 
572 aa  97.1  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  23.59 
 
 
537 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  23.59 
 
 
537 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  22.84 
 
 
538 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  21.68 
 
 
566 aa  77  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4642  hypothetical protein  44.44 
 
 
93 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187996  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2373  transposase  42.86 
 
 
71 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.226178 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  23.38 
 
 
594 aa  70.1  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  23.31 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  23.35 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  23.35 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  23.35 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  23.35 
 
 
604 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  23.03 
 
 
562 aa  66.6  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  24.43 
 
 
548 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  24.43 
 
 
548 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  24.43 
 
 
548 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  22 
 
 
574 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  22.57 
 
 
603 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  22.25 
 
 
562 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  22.73 
 
 
566 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  21.77 
 
 
574 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  22.74 
 
 
604 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.07 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2521  transposase IS1634 family protein  24.54 
 
 
580 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  21.25 
 
 
596 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  21.25 
 
 
596 aa  53.9  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0783  transposase  26.79 
 
 
112 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0197343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  21.25 
 
 
596 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  25.97 
 
 
547 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>