75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3021 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  748    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  56.03 
 
 
538 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  56.03 
 
 
538 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  56.03 
 
 
538 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  56.03 
 
 
538 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  56.03 
 
 
538 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  55.76 
 
 
538 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  56.45 
 
 
537 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  56.45 
 
 
537 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3083  hypothetical protein  52.54 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  28 
 
 
572 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  28 
 
 
572 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  20.9 
 
 
560 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  20.9 
 
 
560 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  20.9 
 
 
560 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  23.82 
 
 
562 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  21.29 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  21.29 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  24 
 
 
552 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  25.95 
 
 
560 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  27.15 
 
 
552 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  22.91 
 
 
604 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  26.24 
 
 
552 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  24.57 
 
 
552 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  23.74 
 
 
552 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  22.08 
 
 
604 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  26.24 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  26.24 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  22.08 
 
 
604 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  26.24 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.08 
 
 
604 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  26.24 
 
 
552 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  22.08 
 
 
604 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  22.08 
 
 
460 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  26.84 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  23.46 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  26.84 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  26.84 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  26.84 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  30.82 
 
 
537 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  26.84 
 
 
552 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0274  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0266253 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0555  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218237  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0662  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.45614  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1070  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0734181  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2539  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.288915 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3134  transposase, IS4  24.68 
 
 
577 aa  53.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  24.34 
 
 
562 aa  53.9  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  25.79 
 
 
552 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  26.57 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  22.15 
 
 
603 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  26.57 
 
 
544 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  24.34 
 
 
562 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  25.79 
 
 
552 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  24.55 
 
 
604 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  24.55 
 
 
604 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 
604 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  30.17 
 
 
541 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  26.24 
 
 
552 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  23.36 
 
 
562 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  22.84 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  22.84 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1821  hypothetical protein  25.68 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  22.84 
 
 
596 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2852  transposase  25.47 
 
 
574 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0325  transposase, IS4 family protein  21.86 
 
 
554 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1783  transposase  25.47 
 
 
574 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>