97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3103 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  90.58 
 
 
552 aa  1028    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  95.65 
 
 
552 aa  1094    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  95.47 
 
 
552 aa  1092    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  95.65 
 
 
552 aa  1094    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  99.64 
 
 
552 aa  1139    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  95.65 
 
 
552 aa  1094    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  95.65 
 
 
552 aa  1094    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  100 
 
 
552 aa  1141    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  91.3 
 
 
552 aa  1039    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  90.94 
 
 
552 aa  1033    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  91.3 
 
 
552 aa  1039    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  90.58 
 
 
552 aa  1030    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  91.3 
 
 
552 aa  1039    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  91.3 
 
 
552 aa  1036    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  91.3 
 
 
552 aa  1039    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  90.58 
 
 
552 aa  1029    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  91.49 
 
 
552 aa  1036    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  90.58 
 
 
552 aa  1029    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  34.07 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  34.07 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  34.07 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  33.82 
 
 
560 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  33.82 
 
 
560 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  33.82 
 
 
560 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  32.24 
 
 
560 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  30.88 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  30.88 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  30.88 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  28.21 
 
 
539 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  28.21 
 
 
539 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  28.21 
 
 
539 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  29.28 
 
 
537 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  28.17 
 
 
507 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  28.57 
 
 
541 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  33.33 
 
 
402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  27.45 
 
 
544 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  27.45 
 
 
544 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  26.44 
 
 
536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  26.26 
 
 
536 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  26.26 
 
 
536 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  26.68 
 
 
531 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  26.68 
 
 
531 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  27.25 
 
 
462 aa  154  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  26.61 
 
 
545 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  25.1 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  27.27 
 
 
417 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  26.93 
 
 
374 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  23.6 
 
 
572 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  23.6 
 
 
572 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  22.94 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0475  transposase  22.94 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  22.94 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1312  transposase  22.94 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  22.94 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1592  transposase  22.94 
 
 
538 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.010832  normal  0.156846 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  26.41 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  21.99 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  21.99 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  20.46 
 
 
603 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  21.88 
 
 
604 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  21.88 
 
 
604 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  21.88 
 
 
604 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  22.09 
 
 
604 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  21.65 
 
 
604 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0511  Transposase-like protein  22.14 
 
 
604 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3806  Transposase-like protein  22.14 
 
 
604 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  26.52 
 
 
596 aa  56.6  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  22.09 
 
 
604 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  26.52 
 
 
596 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  26.52 
 
 
596 aa  55.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  21.53 
 
 
460 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  22.86 
 
 
562 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  25.38 
 
 
548 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  25.38 
 
 
548 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  25.38 
 
 
548 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3021  hypothetical protein  25.44 
 
 
371 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  21.93 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  27.03 
 
 
562 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  22.08 
 
 
562 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  24.83 
 
 
562 aa  48.5  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4319  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0907479  normal  0.222034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1563  hypothetical protein  45.1 
 
 
109 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.468432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>