84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1136 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1136  F420-dependent oxidoreductase, putative  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3977  F420-dependent oxidoreductase, putative  80.88 
 
 		 251 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.082492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1862  F420-dependent oxidoreductase  59.92 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0364  F420-dependent oxidoreductase  66.14 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0961  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  59.51 
 
 		 244 aa  251  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0667  F420-dependent oxidoreductase, putative  49.8 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4045  putative F420-dependent oxidoreductase  45.91 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4151  F420-dependent oxidoreductase  48.79 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120943  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0943  F420-dependent oxidoreductase, putative  51 
 
 		 362 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0885  F420-dependent oxidoreductase, putative  50.2 
 
 		 363 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1118  F420-dependent oxidoreductase, putative  43.75 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 427 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0206  F420-0--gamma-glutamyl ligase  41.2 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7612  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.49 
 
 		 425 aa  181  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4255  F420-dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  51.6 
 
 		 423 aa  180  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.85 
 
 		 526 aa  178  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  46.77 
 
 		 442 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  46.06 
 
 		 431 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  47.24 
 
 		 431 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1718  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.35 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0842791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0744  F420-0--gamma-glutamyl ligase  39.35 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0740  F420-dependent oxidoreductase  44.54 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0911223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0184  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.89 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  43.6 
 
 		 439 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4408  hypothetical protein  42.97 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.966194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  44.92 
 
 		 463 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0061  F420-dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.259311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0964  F420-dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0415  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  47 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24110  F420-dependent oxidoreductase, putative  46.25 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.725805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0020  hypothetical protein  41.53 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.852542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0252  F420-0--gamma-glutamyl ligase  36.57 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.426147  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3571  F420-dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.2 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1409  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.67 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1396  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.97 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1581  F420-dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  45.42 
 
 		 450 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4305  F420-dependent oxidoreductase  48.19 
 
 		 387 aa  151  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.495671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  43.09 
 
 		 446 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  42.08 
 
 		 388 aa  149  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.41 
 
 		 448 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0158  F420-dependent oxidoreductase, putative  37.86 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1849  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.63 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.338881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.12 
 
 		 446 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0855  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.96 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1836  F420-dependent oxidoreductase, putative  44.64 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1335  hypothetical protein  40.6 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.438797  normal  0.0345268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  47.37 
 
 		 458 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0628  protein of unknown function DUF129  32.94 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.605481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1194  F420-dependent oxidoreductase, putative  35.89 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  46.34 
 
 		 471 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1131  F420-dependent oxidoreductase  41.58 
 
 		 283 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.864175  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1413  F420-dependent oxidoreductase  51.97 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2311  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  38.71 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.93 
 
 		 455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2190  F420-dependent oxidoreductase, putative  39.81 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  45.93 
 
 		 455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.98 
 
 		 461 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0783  F420-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.089836  normal  0.0847335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3852  F420-dependent oxidoreductase, putative  40 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0741371  normal  0.0494566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1984  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.98 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000172065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1679  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.98 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0342  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.15 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.188634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  47.97 
 
 		 448 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0742  F420-dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1332  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  31.73 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.151832  normal  0.270056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0850  hypothetical protein  33.68 
 
 		 217 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1380  F420-dependent oxidoreductase, putative  36.65 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.327207 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0419  hypothetical protein  33.97 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0856516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2586  F420-dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0056  hypothetical protein  32.41 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.347627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2468  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20800  F420-dependent oxidoreductase, putative  40.16 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.153088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1139  hypothetical protein  35.62 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.840827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1147  hypothetical protein  34.96 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0885  hypothetical protein  27.88 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0901  hypothetical protein  27.98 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.434409  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0771  hypothetical protein  25.61 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1009  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1744  hypothetical protein  25.47 
 
 		 298 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0936  hypothetical protein  26.09 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.112147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0964  hypothetical protein  24.84 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.321294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>