More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0929 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  94.29 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  75.24 
 
 		 105 aa  174  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  67.62 
 
 		 105 aa  163  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  54.81 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  45.63 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  45.63 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  48.45 
 
 		 238 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  49.52 
 
 		 181 aa  92  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  47.52 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  47.47 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  47.96 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3258  FeS assembly SUF system protein  45.79 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  45.92 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  46.88 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  46.53 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  46.88 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  47.12 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  43.69 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1349  hypothetical protein  41.35 
 
 		 176 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.682238  unclonable  0.00000000000318358 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  44.23 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  45.63 
 
 		 105 aa  87.8  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 		 100 aa  87.4  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  45.54 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  47.96 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  43.88 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  40.38 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  41.35 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0894  FeS assembly SUF system protein SufT  44.23 
 
 		 185 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0898  FeS assembly SUF system protein SufT  44.23 
 
 		 185 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  41.28 
 
 		 108 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  41.51 
 
 		 179 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  40.95 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  42.86 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  43.27 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  43.56 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  41.58 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  41.12 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  40.38 
 
 		 106 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  41.58 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  41.58 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  41.35 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  43.27 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2594  FeS assembly SUF system protein  41.12 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.426933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  42.16 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  41.41 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  40.74 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01362  predicted metal-sulfur cluster enzyme  38.46 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.731864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  42 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  46.24 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  39.81 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  44.33 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  42.71 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42.72 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40.95 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  44.12 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  41.58 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  44.23 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  40.78 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40.78 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3279  FeS assembly SUF system protein  44 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0585568  normal  0.0371399 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  44.12 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1894  FeS assembly SUF system protein SufT  40.95 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.91591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  41.75 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  43.14 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  43.14 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  41.41 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  40.59 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  43.75 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4349  FeS assembly SUF system protein  42.31 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3981  FeS assembly SUF system protein  42.31 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.954909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  38 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0699  FeS assembly SUF system protein  40.38 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.777618  normal  0.0436318 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1419  metal-sulfur cluster enzyme  38.46 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.201751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  41.84 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  43.69 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5784  FeS assembly SUF system protein  42.72 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  39.58 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1196  FeS assembly SUF system protein SufT  41.9 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.448291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  37.38 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0102  hypothetical protein  43.3 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.773865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  39.8 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  39.42 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  39.58 
 
 		 111 aa  76.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  43.16 
 
 		 113 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5105  FeS assembly SUF system protein  40.38 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0151148 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  40 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  39 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  42.16 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>