33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6273 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  100 
 
 		 384 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  68.5 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  68.5 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 376 aa  346  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  33.66 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  31.29 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  33.11 
 
 		 376 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  31.1 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  32.6 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  27.86 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  29.44 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.06 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  27.82 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  30.38 
 
 		 287 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  30.27 
 
 		 534 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  30.74 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  28.81 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  31.34 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.62 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  25.45 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  25.25 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  34.11 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  25.36 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  27.47 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.14 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  30.17 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  29.63 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  26.57 
 
 		 326 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2530  putative sigma54 specific transcriptional regulator  36.36 
 
 		 510 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>