More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4093 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  53.91 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  50 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  50.43 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  50 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  50.43 
 
 		 232 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  49.57 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  49.13 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  50 
 
 		 234 aa  228  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  49.57 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  49.13 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  51.95 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  49.13 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  52.21 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  50.22 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  49.78 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  48.92 
 
 		 232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  49.78 
 
 		 232 aa  216  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  49.35 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  49.78 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  49.78 
 
 		 232 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  48.7 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  47.62 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  48.92 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  48.51 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  45.69 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  47.62 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  38.56 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  35.43 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  43.97 
 
 		 231 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  40.69 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  37.23 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4936  Pirin-like  41.81 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3224  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.911223 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  41.56 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  36.91 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  40.28 
 
 		 238 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  40.26 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  41.63 
 
 		 234 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  37.96 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  36.64 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  41.55 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  38.96 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  37.56 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0629  Pirin domain protein  37.89 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.415085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  37.66 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  40.69 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  36.64 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  38.01 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  36.12 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  40.69 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5536  pirin domain-containing protein  39.66 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.379569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  36.36 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  36.48 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  35.06 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  38.05 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  41.63 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  37.66 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  38.53 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  34.2 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  41.18 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  37.56 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  34.76 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5776  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  37.56 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  36.16 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  37.56 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  37.56 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  35.19 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  37.56 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  35.71 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  37.23 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  38.94 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  36.2 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  36.2 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  36.2 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  35.62 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  36.2 
 
 		 238 aa  144  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  39.73 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1365  Pirin domain protein  35.27 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  36.24 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  35.27 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  35.11 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  37.23 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  36.8 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  38.01 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  36.99 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  34.2 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  35.59 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  35.06 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  36.8 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  36.2 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  34.7 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>