More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1561 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  75 
 
 		 231 aa  360  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  72.41 
 
 		 232 aa  353  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  71.55 
 
 		 232 aa  348  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  71.98 
 
 		 232 aa  344  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  69.83 
 
 		 232 aa  344  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  71.98 
 
 		 232 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  71.55 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  71.12 
 
 		 232 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  69.83 
 
 		 232 aa  339  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  68.53 
 
 		 232 aa  334  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  68.53 
 
 		 232 aa  334  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  67.24 
 
 		 232 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  68.1 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  67.67 
 
 		 233 aa  330  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  67.67 
 
 		 232 aa  328  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  66.81 
 
 		 233 aa  327  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  67.67 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  66.09 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  62.87 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  67.39 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  58.97 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  59.05 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  52.99 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  44.92 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  43.29 
 
 		 236 aa  209  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  47.62 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  47.64 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  46.12 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  48.29 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  46.98 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  45.26 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  40.16 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  46.78 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  44.2 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  42.86 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  42.49 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  45.76 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  43.3 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  44.2 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  43.3 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  43.3 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  43.3 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  43.3 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  41.96 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  43.3 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  45.92 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  43.1 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  43.1 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  41.96 
 
 		 232 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  45.49 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  43.97 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  43.97 
 
 		 241 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  42.98 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  43.97 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  42.98 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  42.06 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  43.53 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  43.59 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  42.06 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  42.06 
 
 		 232 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  40.99 
 
 		 234 aa  184  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  43.1 
 
 		 229 aa  184  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  43.1 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  41.81 
 
 		 241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  41.63 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  42.92 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  41.03 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  41.38 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  42.06 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  41.81 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  42.06 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  41.38 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  42.13 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  42.2 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  42.06 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  42.67 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  40.77 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  41.88 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  40.52 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  41.03 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  41.45 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  41.45 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  41.88 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  41.45 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  40.09 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  41.03 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  40.95 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  39.48 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  42.24 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  40.95 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  40.95 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>