More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4351 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  93.1 
 
 		 232 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  89.66 
 
 		 232 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  87.93 
 
 		 232 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  86.64 
 
 		 232 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  84.91 
 
 		 232 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  75.43 
 
 		 233 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  72.41 
 
 		 232 aa  357  7e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  72.84 
 
 		 232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  72.84 
 
 		 232 aa  352  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  71.98 
 
 		 232 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  69.83 
 
 		 238 aa  344  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  70.26 
 
 		 233 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  69.96 
 
 		 234 aa  336  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  68.1 
 
 		 231 aa  333  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  68.1 
 
 		 232 aa  330  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  68.1 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  67.24 
 
 		 232 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  66.38 
 
 		 233 aa  327  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 		 232 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  64.07 
 
 		 243 aa  315  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  63.36 
 
 		 232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  64.94 
 
 		 232 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  62.34 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  57.51 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  56.41 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  50 
 
 		 232 aa  234  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  51.72 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  48.48 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  42.06 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  45.15 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  43.91 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  46.75 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  45.92 
 
 		 233 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  45.89 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  46.32 
 
 		 241 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  45.89 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  45.02 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  45.49 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  47.09 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  46.15 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  46.35 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  45.25 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  43.97 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  43.97 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  45.85 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  45.25 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  45.25 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  46.15 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  45.25 
 
 		 232 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  45.25 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  45.92 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  46.35 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  45.02 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  45.06 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  45.89 
 
 		 235 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  45.92 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  45.29 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  44.59 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  45.45 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  45.45 
 
 		 241 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  44.8 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  45.92 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  45.45 
 
 		 241 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  44.84 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  44.59 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  44.64 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  45.92 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  45.02 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  44.59 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  45.11 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  45.45 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  44.16 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  42.49 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  45.02 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  43.72 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  43.16 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  41.56 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  43.72 
 
 		 236 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  41.63 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  43.29 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  42.86 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  42.42 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  44.59 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  43.29 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  42.42 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  42.42 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  45.45 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  42.86 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  42.42 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  45.45 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  42.42 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  45.11 
 
 		 234 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>