More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2811 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  71.55 
 
 		 232 aa  342  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 		 233 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  69.26 
 
 		 243 aa  329  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  66.81 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  68.1 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  67.67 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  67.81 
 
 		 234 aa  325  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 		 232 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  65.95 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  66.38 
 
 		 238 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  66.81 
 
 		 232 aa  317  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  65.95 
 
 		 232 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  65.95 
 
 		 233 aa  314  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  70.43 
 
 		 232 aa  314  8e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  65.95 
 
 		 232 aa  314  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  66.38 
 
 		 231 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  65.52 
 
 		 233 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  63.36 
 
 		 232 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  64.22 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  62.93 
 
 		 232 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 		 232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  64.22 
 
 		 232 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  61.64 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  58.55 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  52.99 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  50.21 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  50.22 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  48.93 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  41.63 
 
 		 236 aa  204  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  46.55 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  41.73 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  44.49 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  46.12 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  46.78 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  46.35 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  45.92 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  44.83 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  42.06 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  41.52 
 
 		 232 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  42.49 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  41.52 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  41.52 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  41.52 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  41.88 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  43.97 
 
 		 235 aa  182  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  41.52 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  43.1 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  41.96 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  40.77 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  41.52 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  41.07 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  42.22 
 
 		 232 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  41.07 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  39.38 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  41.07 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  39.48 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  39.48 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  39.22 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  42.67 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  42.67 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  42.67 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  40.87 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  42.24 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  42.24 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  41.81 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  40.34 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  41.38 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  42.67 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  40.95 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  43.84 
 
 		 231 aa  174  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  39.91 
 
 		 239 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  38.36 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  42.67 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  41.81 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  43.16 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  38.79 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  39.66 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  41.7 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  41.33 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  40.77 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  40.34 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  37.93 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  40.34 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  42.01 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  41.7 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  39.22 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  39.66 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  39.66 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  41.28 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>