123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2644 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  717    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0813  hypothetical protein  70.66 
 
 		 355 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0785  protein of unknown function DUF72  57.71 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.223922 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0715  protein of unknown function DUF72  57.14 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.044641  normal  0.0915207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0765  hypothetical protein  62.66 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.143157 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0512  hypothetical protein  49.7 
 
 		 379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204603  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2570  hypothetical protein  48.37 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2594  hypothetical protein  47.45 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1959  hypothetical protein  48.37 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.479808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2618  hypothetical protein  50 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3223  protein of unknown function DUF72  47.92 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.873397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5902  hypothetical protein  51.09 
 
 		 431 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.834599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2489  hypothetical protein  49.85 
 
 		 440 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.457254  normal  0.59095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2789  protein of unknown function DUF72  49.53 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0971015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0726  hypothetical protein  48.43 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.299364 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0715  hypothetical protein  47.29 
 
 		 505 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0023847  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0739  hypothetical protein  48.81 
 
 		 422 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0357  hypothetical protein  50.33 
 
 		 522 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000555141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1059  hypothetical protein  50.67 
 
 		 519 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0657  hypothetical protein  50.33 
 
 		 522 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2492  hypothetical protein  50.33 
 
 		 522 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000876051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0899  hypothetical protein  50.33 
 
 		 525 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0105  hypothetical protein  50.33 
 
 		 522 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0559982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0902  hypothetical protein  50 
 
 		 525 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0290977  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1999  protein of unknown function DUF72  45.2 
 
 		 363 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1704  hypothetical protein  45.95 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.792663 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1823  hypothetical protein  42.13 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.599232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1869  hypothetical protein  43.56 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3371  hypothetical protein  42.28 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241512  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0200  protein of unknown function DUF72  39.11 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1934  protein of unknown function DUF72  32.92 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.978403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3869  hypothetical protein  26.46 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0151783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  26.6 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  26.92 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  26.32 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  27.36 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  29.47 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  25.53 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  24.14 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  24.14 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  24.51 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  24.4 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  23.76 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  28.04 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  27.19 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  28.93 
 
 		 270 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  28.35 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.73 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  25.25 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  28.12 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  23 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  23.56 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  26.72 
 
 		 259 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  27.35 
 
 		 249 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  26.4 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  23.27 
 
 		 267 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  22.66 
 
 		 274 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  23.65 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3144  protein of unknown function DUF72  30.11 
 
 		 249 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  30.88 
 
 		 247 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  28.72 
 
 		 247 aa  53.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  25.57 
 
 		 247 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  28 
 
 		 303 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  27.36 
 
 		 321 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  26.17 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  27.41 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  26.98 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  24.24 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  28.17 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  25.89 
 
 		 313 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3332  protein of unknown function DUF72  30.22 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000208142 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  24.59 
 
 		 251 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  28.91 
 
 		 312 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30.35 
 
 		 244 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  24.27 
 
 		 318 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  22.61 
 
 		 268 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  23.81 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  24.88 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  29.19 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3871  hypothetical protein  33.08 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4912  hypothetical protein  30.26 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  28.95 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.1 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  23.04 
 
 		 264 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  23.78 
 
 		 267 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  23.19 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  25.58 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  24.48 
 
 		 251 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  21.45 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  21.45 
 
 		 261 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.95 
 
 		 249 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  22.33 
 
 		 308 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  29.95 
 
 		 243 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5255  protein of unknown function DUF72  26.79 
 
 		 280 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.455274  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  25.35 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  26.04 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  25.68 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  24.63 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>