More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2141 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2141  patatin  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  83.7 
 
 		 311 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  69.75 
 
 		 319 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  69.41 
 
 		 318 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  68.85 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  62.66 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  63.31 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  60.84 
 
 		 317 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  63.38 
 
 		 358 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  64.98 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  63.04 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  63.04 
 
 		 306 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  63.04 
 
 		 347 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  63.04 
 
 		 347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  62.68 
 
 		 347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  62.73 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  59.28 
 
 		 308 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  58.28 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  58.28 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  58.28 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  61.6 
 
 		 302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  56.95 
 
 		 302 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  52.16 
 
 		 346 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  63.04 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  63.04 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  52.17 
 
 		 346 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  56 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  56.81 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  54.51 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  56.82 
 
 		 293 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  53.17 
 
 		 345 aa  285  9e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  57.42 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  58.17 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  58.3 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  54.48 
 
 		 327 aa  277  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  57.43 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  59.35 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  63.91 
 
 		 223 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  41.83 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  43.4 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  43.02 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  43.02 
 
 		 320 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  38.44 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.74 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  38.89 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  39.13 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  40.08 
 
 		 273 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  37.07 
 
 		 751 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  36.96 
 
 		 728 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2248  patatin  38.21 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000483093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  40.27 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  37.58 
 
 		 728 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  38.67 
 
 		 262 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.98 
 
 		 727 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  35.08 
 
 		 253 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  36.74 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  35.39 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.91 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  35.21 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  36.43 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  40.78 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  36.34 
 
 		 667 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.2 
 
 		 263 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  40.39 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  35 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  34.23 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  34.67 
 
 		 760 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  46.35 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  34.62 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.79 
 
 		 728 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.91 
 
 		 733 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  35.42 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  35.42 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  35.42 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  35.42 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  35.42 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  35 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  35.42 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  35.42 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  34.78 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  35 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  34.93 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  37.42 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  33.64 
 
 		 354 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  37.23 
 
 		 748 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  36.69 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  38.18 
 
 		 728 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  38.14 
 
 		 728 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  37.98 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  37.05 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.89 
 
 		 767 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  41.92 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  34.98 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  44.33 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  42.78 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  43.59 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  43.59 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  35.23 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  43.96 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  43.24 
 
 		 315 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>