260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0131 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0131  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0440313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0167  ATP-dependent protease peptidase subunit  97.19 
 
 		 178 aa  327  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0043  ATP-dependent protease peptidase subunit  89.89 
 
 		 178 aa  305  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3384  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.08 
 
 		 178 aa  299  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3707  ATP-dependent protease peptidase subunit  87.64 
 
 		 178 aa  299  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3108  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.71 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.192963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0165  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.02 
 
 		 214 aa  292  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2477  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.71 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3091  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.71 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.28 
 
 		 178 aa  291  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3086  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.71 
 
 		 178 aa  290  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0495645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0343  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.71 
 
 		 178 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3000  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.15 
 
 		 178 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.209191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3254  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0191  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.834819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0386  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3432  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0201  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2916  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0771725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2173  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.46 
 
 		 178 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4380  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.15 
 
 		 178 aa  287  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3138  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.58 
 
 		 178 aa  286  9e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0070  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.15 
 
 		 178 aa  285  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6441  ATP-dependent protease peptidase subunit  82.58 
 
 		 178 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.72 
 
 		 178 aa  283  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.48 
 
 		 181 aa  279  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.48 
 
 		 181 aa  278  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.38 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.48 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.32 
 
 		 188 aa  271  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.66 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.66 
 
 		 182 aa  267  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.1 
 
 		 182 aa  266  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.54 
 
 		 187 aa  265  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.23 
 
 		 194 aa  265  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.8 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 181 aa  258  3e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.76 
 
 		 176 aa  258  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 204 aa  258  5.0000000000000005e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.8 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 183 aa  253  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  64.04 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.98 
 
 		 178 aa  250  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.42 
 
 		 172 aa  248  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.51 
 
 		 182 aa  248  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 174 aa  247  7e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.28 
 
 		 174 aa  247  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.15 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3389  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.06 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 183 aa  245  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.44 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.02 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 174 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  239  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 174 aa  240  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.02 
 
 		 175 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.79 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 174 aa  238  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4559  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.54 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.25 
 
 		 174 aa  238  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.08 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  236  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.5 
 
 		 176 aa  235  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 		 176 aa  235  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  234  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.91 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.37 
 
 		 176 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  63.74 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00724  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 183 aa  228  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  62.92 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 		 182 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 		 177 aa  227  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.04 
 
 		 180 aa  226  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.53 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.92 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.12 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>