More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1100 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1100  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000000402259  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1189  SNARE associated Golgi protein  35.56 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.260888  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1018  DedA family protein  31.43 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1183  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 		 214 aa  99.8  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.15 
 
 		 202 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1374  DedA family protein  33.83 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  32.46 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  29.9 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.44 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  31.74 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  33.75 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0747  alkaline phosphatase  30.72 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1193  DedA family protein  36.26 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.401801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  29.89 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  26.87 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  29.63 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  26.96 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  31.4 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  28.95 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  29.74 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  28.03 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  30.32 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  30.81 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  24.38 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1772  SNARE associated Golgi protein  26.9 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  29.94 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0869  hypothetical protein  28.25 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0574  SNARE associated Golgi protein  31.35 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.32 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  27.07 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  28.16 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.27 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  27.17 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  29.35 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  27.17 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  29.44 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1106  SNARE associated Golgi protein  31.18 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  24.28 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  29.21 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.19 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  31.07 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  28.98 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  30 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  28.98 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  30.22 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  28.36 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  29.81 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  23.79 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  25.98 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0079  membrane protein  33.33 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  28.27 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  29.2 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  25.39 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  25.99 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  29.53 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  29.2 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  23.79 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  30.29 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  25.99 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  25.99 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  26.55 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  25.99 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  30.08 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  25.99 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.35 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1436  DedA family protein  31.66 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  26.88 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  26.11 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  25.99 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  22.73 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  25.14 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20761  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.19 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.167528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2149  dedA family protein  25.37 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.540415  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  22.73 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2652  dedA family protein  25.14 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000160491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  25.14 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  26.46 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2842  DedA family protein  25.14 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580613  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  30.63 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  26.25 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2872  dedA family protein  25.71 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0269075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  25.89 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1201  DedA family alkaline phosphatase-like protein  26.32 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  25.89 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  28.57 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  25.89 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  29.79 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>