35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0361 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0361  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  975    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1640  hypothetical protein  35.68 
 
 
424 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1533  hypothetical protein  35.68 
 
 
424 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1730  hypothetical protein  35.68 
 
 
424 aa  229  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3891  hypothetical protein  33 
 
 
703 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0944  hypothetical protein  31.77 
 
 
718 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2270  hypothetical protein  34.94 
 
 
672 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.417256  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1200  hypothetical protein  25.83 
 
 
348 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
759 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3115  hypothetical protein  24.19 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
747 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3375  glycosyl transferase  28.4 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000640117  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5603  glycosyltransferase  25.26 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
774 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1785  hypothetical protein  25.71 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0543  hypothetical protein  27.64 
 
 
338 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  35.58 
 
 
763 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4312  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 
756 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
780 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1449  glycosyl transferase  23.31 
 
 
353 aa  57.4  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0783  glycosyltransferase  36.78 
 
 
404 aa  57  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5215  putative glycosyltransferase  36.59 
 
 
340 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1917  hypothetical protein  22.37 
 
 
339 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1965  hypothetical protein  42.42 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1053  putative glycosyltransferase  43.86 
 
 
340 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
823 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
767 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  35.96 
 
 
759 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  43.1 
 
 
774 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1622  hypothetical protein  40 
 
 
360 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.681183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1241  hypothetical protein  34.57 
 
 
371 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3440  mannosyltransferase  39.73 
 
 
348 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.106882  normal  0.942853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 
378 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
765 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7536  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
762 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961442  normal  0.148012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>