58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6545 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6545  NIPSNAP family containing protein  100 
 
 		 107 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344991  normal  0.706703 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5588  NIPSNAP family containing protein  98.13 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6250  NIPSNAP family protein  77.45 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.441941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2212  NIPSNAP family protein  65.69 
 
 		 104 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00220241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0611  NIPSNAP family containing protein  51.96 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4320  NIPSNAP family protein  53.92 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353616  normal  0.0756838 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3880  NIPSNAP family protein  45 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.273417 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3143  hypothetical protein  45 
 
 		 113 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2528  NIPSNAP domain-containing protein  50.98 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6438  NIPSNAP family containing protein  46 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2268  NIPSNAP  45.63 
 
 		 108 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.509505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0041  NIPSNAP family protein  43 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1114  hypothetical protein  40.38 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20230  hypothetical protein  43 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3219  NIPSNAP family protein  43.27 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6486  hypothetical protein  45.83 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.870097  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6721  NIPSNAP family protein  45.83 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.246115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2151  NIPSNAP family protein  40 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.341026 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0586  NIPSNAP family protein  37.25 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2134  hypothetical protein  42.72 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1039  NIPSNAP family protein  40.2 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0070  hypothetical protein  40.2 
 
 		 109 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3119  NIPSNAP family protein  44.23 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2606  NIPSNAP family containing protein  44.23 
 
 		 106 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.288716  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5546  NIPSNAP family containing protein  35.29 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2132  hypothetical protein  46.23 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3611  hypothetical protein  36.84 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4010  NIPSNAP family protein  32.32 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2746  NIPSNAP family protein  33.7 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2604  NIPSNAP family protein  33.7 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.565176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2693  NIPSNAP family protein  29.59 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0954224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2725  NIPSNAP family containing protein  31.18 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2711  NIPSNAP family protein  29.47 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00332524  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2293  NIPSNAP domain-containing protein  30.84 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04779  NIPSNAP family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G06660)  27.72 
 
 		 388 aa  52  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0962984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3225  NIPSNAP family containing protein  29.52 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.990074  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03240  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0352937  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2786  NIPSNAP  28.57 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0225212  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2700  NIPSNAP family protein  39.19 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.818576  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5521  hypothetical protein  36.27 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678586  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5885  NIPSNAP family protein  36.27 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.433649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1202  NIPSNAP family protein  27.08 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5493  hypothetical protein  25.53 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49396  predicted protein  33.03 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.699819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2157  NIPSNAP family protein  35.92 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0395  NIPSNAP family containing protein  25.71 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6394  NIPSNAP family protein  34.31 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4475  hypothetical protein  30.48 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1821  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3412  NIPSNAP family protein  26.67 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.870754  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89274  predicted protein  23.81 
 
 		 270 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0444198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6103  NIPSNAP family protein  29.7 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.97177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0760  NIPSNAP family containing protein  27.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2703  NIPSNAP family protein  32.89 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.82226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2345  NIPSNAP family containing protein  37.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2856  NIPSNAP family protein  37.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>