More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5142 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  73.52 
 
 
567 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  70.86 
 
 
560 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  63.06 
 
 
557 aa  706    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  73.15 
 
 
579 aa  771    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  64.68 
 
 
515 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  67.48 
 
 
552 aa  707    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  66.87 
 
 
526 aa  702    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  75.2 
 
 
522 aa  800    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  100 
 
 
544 aa  1132    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  56.52 
 
 
547 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  60.12 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  60.08 
 
 
496 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  58.1 
 
 
548 aa  595  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  57.46 
 
 
533 aa  588  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  58.55 
 
 
512 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  53.78 
 
 
545 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  56.01 
 
 
555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  55.97 
 
 
549 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  54.92 
 
 
514 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  54.92 
 
 
514 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  54.81 
 
 
554 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  57.98 
 
 
512 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  54.69 
 
 
525 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  58 
 
 
505 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  57.8 
 
 
505 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  54.18 
 
 
505 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  57.2 
 
 
502 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  57.77 
 
 
508 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  55.34 
 
 
525 aa  548  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  51.39 
 
 
513 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  54.12 
 
 
521 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  50.95 
 
 
552 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  52.99 
 
 
522 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  51.5 
 
 
522 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  47.09 
 
 
510 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  46.39 
 
 
564 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  44.53 
 
 
508 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  44.05 
 
 
546 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  43.34 
 
 
542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  42.88 
 
 
512 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  43.79 
 
 
517 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  34.69 
 
 
569 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  33.39 
 
 
556 aa  231  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  32.35 
 
 
554 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  32.86 
 
 
470 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  32.71 
 
 
569 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  32.16 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  31.98 
 
 
555 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  33.27 
 
 
561 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.05 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  31.76 
 
 
590 aa  213  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.84 
 
 
462 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  32.6 
 
 
561 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  31.88 
 
 
440 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.6 
 
 
524 aa  207  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  31.43 
 
 
551 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  32.06 
 
 
551 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.43 
 
 
551 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.43 
 
 
551 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.43 
 
 
551 aa  204  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  31.35 
 
 
496 aa  196  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.45 
 
 
480 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30.89 
 
 
550 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.15 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.28 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.48 
 
 
553 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.75 
 
 
500 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.04 
 
 
457 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.12 
 
 
506 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.05 
 
 
497 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.72 
 
 
471 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.28 
 
 
452 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.96 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.96 
 
 
497 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.96 
 
 
497 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.3 
 
 
497 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.77 
 
 
497 aa  153  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.5 
 
 
440 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.29 
 
 
520 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.81 
 
 
638 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  27.99 
 
 
487 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.79 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.54 
 
 
440 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.52 
 
 
462 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.13 
 
 
482 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  25.94 
 
 
526 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  27.42 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.12 
 
 
526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.47 
 
 
543 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.49 
 
 
472 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.16 
 
 
470 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.88 
 
 
486 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.13 
 
 
507 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.07 
 
 
501 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.25 
 
 
517 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.68 
 
 
491 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.54 
 
 
536 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.33 
 
 
470 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.3 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.11 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>