283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4458 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4170  basic membrane lipoprotein  95.76 
 
 		 330 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4458  basic membrane lipoprotein  100 
 
 		 330 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.954654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0256  membrane lipoprotein  82.73 
 
 		 330 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3416  basic membrane lipoprotein  65.96 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2842  putative lipoprotein  62.42 
 
 		 329 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0285337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3982  basic membrane lipoprotein  60.91 
 
 		 332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0561  basic membrane lipoprotein  59.94 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.491172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0861  basic membrane lipoprotein  58.36 
 
 		 330 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0435568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3587  basic membrane lipoprotein  57.53 
 
 		 334 aa  391  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1297  basic membrane lipoprotein  56.63 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2211  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.98 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0886  basic membrane lipoprotein  60.98 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.701792  normal  0.681633 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3094  basic membrane lipoprotein  60.39 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0725  basic membrane lipoprotein  55.8 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0632  basic membrane lipoprotein  55.18 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000331653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2282  basic membrane lipoprotein  57.79 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0528  basic membrane lipoprotein  57.28 
 
 		 328 aa  361  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1152  basic membrane lipoprotein  43.53 
 
 		 337 aa  255  8e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6739  basic membrane lipoprotein  41.83 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0695  basic membrane lipoprotein  41.23 
 
 		 370 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.716466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1773  basic membrane lipoprotein  45.6 
 
 		 346 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000346516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1775  basic membrane lipoprotein  45.48 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000483055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1669  basic membrane lipoprotein  38.83 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.108575  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0155  basic membrane lipoprotein  40.84 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1782  basic membrane lipoprotein  44.44 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2088  basic membrane lipoprotein  39.26 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00670  basic membrane lipoprotein  41.14 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2234  basic membrane lipoprotein  37.24 
 
 		 366 aa  225  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.511014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0507  basic membrane lipoprotein  38.44 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0401  basic membrane lipoprotein  41.27 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0792  basic membrane protein A  37.93 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1031  basic membrane lipoprotein  35.87 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1269  ABC-type transport system substrate-binding protein  40.06 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1268  basic membrane lipoprotein  37.01 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0989  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 		 349 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1352  basic membrane lipoprotein  36.71 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1302  basic membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3643  Bmp family lipoprotein  39.03 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0147577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3533  Bmp family lipoprotein  39.03 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000828117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3927  Bmp family lipoprotein  39.03 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00253891  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3804  lipoprotein, Bmp family  39.03 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.8668e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3551  Bmp family lipoprotein  39.03 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00365158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0703  basic membrane lipoprotein  34.52 
 
 		 378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.183681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2443  basic membrane lipoprotein  38.96 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00385845  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3541  basic membrane lipoprotein  38.36 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3839  lipoprotein, Bmp family  38.71 
 
 		 355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00070149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05390  nucleoside-binding protein  41.22 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3826  Bmp family lipoprotein  38.71 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3562  basic membrane lipoprotein  37.85 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000448053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0676  basic membrane lipoprotein  40.89 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.748754  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1409  lipoprotein, Bmp family  38.39 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000408394  hitchhiker  0.00113349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0560  basic membrane lipoprotein  35.09 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3239  basic membrane lipoprotein  39.14 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.101235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1340  basic membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0748  basic membrane lipoprotein  34.81 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.140474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0713  basic membrane lipoprotein  37.78 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000562665  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3630  basic membrane lipoprotein  36.88 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3890  nucleoside-binding protein  37.05 
 
 		 361 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6454  basic membrane lipoprotein  39.23 
 
 		 382 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1417  basic membrane lipoprotein  36.36 
 
 		 389 aa  185  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1176  basic membrane lipoprotein  38.44 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3919  basic membrane lipoprotein  35.24 
 
 		 566 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.308906  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1590  basic membrane lipoprotein  38.29 
 
 		 407 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0787459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1783  basic membrane lipoprotein  33.92 
 
 		 340 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000546554  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1844  basic membrane lipoprotein  37.39 
 
 		 413 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.437172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2068  basic membrane lipoprotein  38.24 
 
 		 363 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0476  basic membrane lipoprotein  36.47 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000930051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3050  basic membrane lipoprotein  36.07 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0628382  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1644  basic membrane lipoprotein  36.84 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.848912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3654  basic membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0033  basic membrane lipoprotein  33.65 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1018  basic membrane lipoprotein  35.46 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903819 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0420  basic membrane lipoprotein  34.77 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000250374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3016  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4403  basic membrane lipoprotein  39.29 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2113  basic membrane lipoprotein  34.41 
 
 		 354 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.07207e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1007  basic membrane protein A  32.27 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0822  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0845  basic membrane lipoprotein  33.15 
 
 		 359 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0904  basic membrane lipoprotein  32.92 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.455123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1902  basic membrane lipoprotein  33.73 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0969848  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0915  basic membrane lipoprotein  32.04 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0004  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 366 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2515  basic membrane lipoprotein  33.33 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3761  basic membrane lipoprotein  32.79 
 
 		 713 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.442402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1576  basic membrane lipoprotein  33.22 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1680  basic membrane lipoprotein  31.62 
 
 		 366 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0132678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0142  basic membrane lipoprotein  34.19 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1527  basic membrane protein A  31.93 
 
 		 351 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000178114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0016  basic membrane lipoprotein  32.14 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1312  basic membrane lipoprotein  35.31 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.469912  normal  0.943488 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1516  Bmp family lipoprotein  30.24 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.46456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1306  membrane lipoprotein tmpC precursor  29.9 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.116551  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0437  ABC transporter periplasmic protein  34.16 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0405  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.52 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.795161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4441  basic membrane lipoprotein  32.73 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0481892  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2121  basic membrane lipoprotein  33.11 
 
 		 348 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0010  Bmp family lipoprotein  32.93 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0007  Bmp family lipoprotein  32.93 
 
 		 368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>