More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3895 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  90.36 
 
 		 394 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 391 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  68.05 
 
 		 382 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  63.78 
 
 		 395 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  58.1 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  58.87 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  56.88 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  51.44 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  52.6 
 
 		 408 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  48.71 
 
 		 390 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  48.53 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  51.96 
 
 		 375 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 		 366 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  50.52 
 
 		 367 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  49.87 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  50.14 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  42.08 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  39.57 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  37.87 
 
 		 419 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  37.99 
 
 		 470 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  39.84 
 
 		 340 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  40.11 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  39.02 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  36.31 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  36.19 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  36.99 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.01 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  36.68 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  37.47 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  36.34 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  37.71 
 
 		 345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  37.6 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  36.05 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  36.36 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  57.06 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 		 328 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  36.64 
 
 		 363 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  36.36 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.34 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.79 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.64 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.98 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.96 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.85 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.81 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  35.1 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  36.97 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.23 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.12 
 
 		 316 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  37.4 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 		 362 aa  186  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.79 
 
 		 353 aa  185  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.68 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.04 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.12 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.69 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.76 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.91 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.49 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.12 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.56 
 
 		 316 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.84 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.95 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.34 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.56 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.57 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.74 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.11 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.6 
 
 		 323 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 		 332 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 355 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  37.3 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  34.48 
 
 		 347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  36.65 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 		 320 aa  173  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.35 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  44.93 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.07 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  44.44 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 339 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.96 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.48 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.52 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.79 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>