More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1655 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  497  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  45.83 
 
 
262 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2845  ABC transporter related  46.67 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1483  ABC transporter related  43.22 
 
 
255 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  46.67 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0892  ABC transporter ATP-binding protein  37.93 
 
 
254 aa  177  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0662461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
259 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1426  ABC transporter related protein  44.76 
 
 
256 aa  174  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1170  ABC transporter related  44.3 
 
 
250 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.842608  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_29  iron ion ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 
248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.3 
 
 
257 aa  160  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40.66 
 
 
256 aa  155  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1042  hypothetical protein  37.55 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.660345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
269 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01870  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.55 
 
 
322 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.110176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  38.1 
 
 
266 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  36.52 
 
 
262 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  37.1 
 
 
265 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3468  ABC transporter related  44.39 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  34.94 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  37.4 
 
 
257 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  37.4 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  36.69 
 
 
264 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1201  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  33.93 
 
 
257 aa  145  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  34.14 
 
 
278 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  37.18 
 
 
269 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3223  ABC transporter component  38.84 
 
 
274 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2736  ABC transporter related  39.08 
 
 
261 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  33.73 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  40.35 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1286  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  38.31 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  36.03 
 
 
256 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  36.17 
 
 
278 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1987  ABC transporter related  37.97 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1285  ABC transporter related  38.94 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.562669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0280  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
242 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1532  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  36.8 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  34.54 
 
 
285 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  37.9 
 
 
253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0601  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 
245 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  36.44 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  35.02 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  32.75 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  36.14 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.14 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2074  ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 
276 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1472  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
247 aa  131  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  33.62 
 
 
268 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  31.84 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  34.35 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1539  ABC transporter-related protein  30.19 
 
 
261 aa  129  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.3 
 
 
258 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0955  ABC transporter related  36.25 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
252 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.47 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  32.89 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4650  ABC transporter related  39.82 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.499061  hitchhiker  0.000876955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  33.78 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  36.71 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1531  ABC transporter-related protein  39.06 
 
 
256 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.821466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  32.49 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1615  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 
259 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.78 
 
 
246 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  34.36 
 
 
275 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  34.62 
 
 
274 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  34.62 
 
 
274 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31320  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.86 
 
 
248 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
250 aa  125  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  32.38 
 
 
256 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3699  ABC transporter related  32.68 
 
 
288 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  33.98 
 
 
275 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
277 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3500  ABC Fe3+-hydroxamate/cobalamin transporter, ATPase subunit  36.76 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2478  ABC transporter related  34.73 
 
 
266 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.144561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1626  ABC transporter related  38.67 
 
 
256 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  33.62 
 
 
260 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  30.86 
 
 
276 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  35.78 
 
 
263 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  30.47 
 
 
258 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.17 
 
 
259 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3032  ABC transporter related  38.33 
 
 
256 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2063  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
260 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
258 aa  122  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1463  ABC transporter related  39.21 
 
 
264 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  32.2 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  29.74 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  35.34 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  34.31 
 
 
444 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2338  ABC transporter, ATPase subunit  37.89 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  36.21 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.08 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  35.12 
 
 
264 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1658  metal transport system ATP-binding protein  35.4 
 
 
298 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>