More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6513 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6513  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
336 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6100  oxidoreductase domain protein  94.05 
 
 
336 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207397  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4491  oxidoreductase-like  58.54 
 
 
339 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0267  oxidoreductase domain protein  53.15 
 
 
387 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0049  oxidoreductase domain protein  52.25 
 
 
391 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595236  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5583  oxidoreductase  50.91 
 
 
342 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2442  oxidoreductase domain-containing protein  51.34 
 
 
342 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3326  oxidoreductase domain-containing protein  49.11 
 
 
338 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4492  oxidoreductase-like  50.74 
 
 
342 aa  330  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2165  oxidoreductase domain protein  47.76 
 
 
335 aa  306  3e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.97582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4054  oxidoreductase domain protein  45.67 
 
 
357 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2507  oxidoreductase domain protein  46.59 
 
 
335 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.762014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1648  oxidoreductase domain protein  45.29 
 
 
360 aa  289  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01560  predicted dehydrogenase  45.32 
 
 
362 aa  288  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0585  Oxidoreductase domain  45.67 
 
 
362 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299312  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1594  oxidoreductase domain protein  41.79 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1988  oxidoreductase domain-containing protein  44.44 
 
 
391 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0347113 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0600  oxidoreductase domain-containing protein  41.79 
 
 
362 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3349  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 
327 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.773836  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2078  oxidoreductase domain protein  24.82 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  32.86 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  31.08 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1757  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.564718  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1283  oxidoreductase domain protein  24.07 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0628466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  32.21 
 
 
346 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2113  oxidoreductase domain protein  28.62 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2307  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 
715 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  26.05 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  32.67 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  32.67 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  32.67 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.92 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  25.4 
 
 
346 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0682  oxidoreductase domain-containing protein  26.39 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0778867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2288  oxidoreductase domain-containing protein  27.75 
 
 
343 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0341888  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2179  oxidoreductase domain protein  29.73 
 
 
389 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000944475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 
428 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05520  predicted dehydrogenase  26.19 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  30.67 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.9 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3165  oxidoreductase-like  28.48 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  25.87 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0519  oxidoreductase domain-containing protein  23.1 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00249264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0495  oxidoreductase domain-containing protein  23.1 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0650214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2197  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 
363 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  31.33 
 
 
348 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  30.34 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2396  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
431 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2425  oxidoreductase domain-containing protein  28.38 
 
 
389 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  26.39 
 
 
347 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  22.43 
 
 
344 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.64 
 
 
319 aa  59.7  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  32.58 
 
 
359 aa  59.7  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09791  putative oxidoreductase  26.14 
 
 
373 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.678537  normal  0.0468377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2804  oxidoreductase domain protein  25.81 
 
 
342 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.15 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  26.26 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3569  oxidoreductase domain-containing protein  29.61 
 
 
345 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  30.88 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0838  oxidoreductase domain-containing protein  25.97 
 
 
367 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  26.76 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08431  putative oxidoreductase  24.22 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
425 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  28.4 
 
 
360 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  31.54 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  31.54 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
346 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  32.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4070  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 
734 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  32.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  32.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  31.82 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  32.03 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  31.82 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.47 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491468  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  27.14 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 
375 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06530  predicted dehydrogenase  29.32 
 
 
387 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0363846  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  25.36 
 
 
346 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0795  putative oxidoreductase  23.75 
 
 
355 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.463333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  32.03 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  24.43 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  30.77 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 
384 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  24.29 
 
 
387 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 
374 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08461  putative oxidoreductase  23.77 
 
 
365 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1238  oxidoreductase domain protein  27.89 
 
 
393 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2682  oxidoreductase domain-containing protein  23.75 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
374 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2322  oxidoreductase domain-containing protein  28.83 
 
 
320 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>