More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2755 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
275 aa  541  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  92 
 
 
275 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  77.74 
 
 
274 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  75.28 
 
 
273 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.55 
 
 
281 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.3 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.44 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.76 
 
 
278 aa  241  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.81 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 
273 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.92 
 
 
274 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.65 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.64 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.04 
 
 
278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.69 
 
 
276 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.64 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.71 
 
 
301 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.64 
 
 
272 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 
273 aa  219  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.03 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.04 
 
 
271 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.04 
 
 
271 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.62 
 
 
277 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.13 
 
 
277 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.76 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 
280 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.68 
 
 
271 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
273 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 
273 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.17 
 
 
255 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 
273 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
269 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
273 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.07 
 
 
273 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.49 
 
 
274 aa  184  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.22 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 
272 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
272 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.66 
 
 
268 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.87 
 
 
272 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.64 
 
 
272 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
272 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 
272 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 
273 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
282 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  42.55 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.27 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.04 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.18 
 
 
285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.03 
 
 
279 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
271 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
289 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 
267 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.29 
 
 
273 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.02 
 
 
270 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.04 
 
 
273 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3184  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
272 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000288321  normal  0.0381756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3026  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
272 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000130483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.59 
 
 
280 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1337  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
272 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00148395  hitchhiker  0.00000622504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
272 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000943261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 
274 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 
264 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.07 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.9 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2688  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.452831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.86 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
277 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 
282 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  42.59 
 
 
262 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
270 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.38 
 
 
289 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.74 
 
 
284 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.79 
 
 
270 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.39 
 
 
273 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 
271 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
271 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.58 
 
 
270 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
278 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
272 aa  158  9e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 
278 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 
270 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.22 
 
 
276 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
273 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
272 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.57 
 
 
276 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
272 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>