More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2053 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.51 
 
 
622 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  63.56 
 
 
589 aa  721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  79.53 
 
 
592 aa  957    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  60.99 
 
 
626 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  61.25 
 
 
619 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  63.71 
 
 
598 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.06 
 
 
623 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  61.15 
 
 
609 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  60.33 
 
 
604 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  60.77 
 
 
622 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  90.69 
 
 
591 aa  1070    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  63.77 
 
 
596 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  100 
 
 
589 aa  1180    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.25 
 
 
619 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  60.61 
 
 
625 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  61.25 
 
 
619 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  60.86 
 
 
691 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  56.53 
 
 
589 aa  621  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  59.56 
 
 
596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  53.39 
 
 
581 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  54.92 
 
 
576 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  58.24 
 
 
435 aa  482  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.71 
 
 
466 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  55.94 
 
 
466 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  53.17 
 
 
469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50.72 
 
 
404 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  51.21 
 
 
403 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0074  thioredoxin-like protein  54.46 
 
 
381 aa  355  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  33.57 
 
 
695 aa  260  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.07 
 
 
570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.40474  normal  0.105344 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0817  redoxin domain-containing protein  37.85 
 
 
369 aa  219  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.234537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  60 
 
 
189 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17110  cytochrome c biogenesis protein  30.32 
 
 
659 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473762  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  61.54 
 
 
188 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  54.86 
 
 
187 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  60.4 
 
 
193 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  60.4 
 
 
193 aa  194  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  56.55 
 
 
178 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  57.93 
 
 
178 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  61.11 
 
 
193 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  60.69 
 
 
197 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  60.69 
 
 
197 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  61.11 
 
 
193 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  54.48 
 
 
184 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.52 
 
 
200 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  55.17 
 
 
178 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  55.56 
 
 
186 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  62.88 
 
 
193 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1839  hypothetical protein  43.03 
 
 
249 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  44.19 
 
 
581 aa  140  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  38.03 
 
 
503 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.86 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  38.03 
 
 
504 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  39.87 
 
 
674 aa  108  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  36.57 
 
 
697 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  43.33 
 
 
672 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  36.84 
 
 
699 aa  107  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.44 
 
 
628 aa  106  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.14 
 
 
639 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  37.86 
 
 
644 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  31.71 
 
 
634 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.8 
 
 
612 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.46 
 
 
612 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
612 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  37.18 
 
 
487 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  34.39 
 
 
498 aa  100  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.86 
 
 
688 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.18 
 
 
641 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  21.39 
 
 
403 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  21.2 
 
 
403 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  37.8 
 
 
584 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  24.11 
 
 
735 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  31.72 
 
 
167 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1857  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.96 
 
 
280 aa  82  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3286  cytochrome c biogenesis protein  36.45 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.549106  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1223  hypothetical protein  32 
 
 
172 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1221  peroxiredoxin-like protein  30.72 
 
 
173 aa  78.6  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4168  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.44 
 
 
238 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  20.33 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.77 
 
 
196 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.71 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  30.47 
 
 
168 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2330  redoxin domain-containing protein  31.39 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0220843  normal  0.114358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.24 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0625  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  26.42 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254144  normal  0.888006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.27 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  26.99 
 
 
470 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  32.84 
 
 
169 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2100  thioredoxin family protein  29.25 
 
 
155 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1895  redoxin domain-containing protein  26.57 
 
 
189 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.132277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.23 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
187 aa  68.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  32.58 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  30.5 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  31.69 
 
 
166 aa  67.4  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0736  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.41 
 
 
222 aa  67  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.592681  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3551  thiol:disulfide interchange protein DsbE, putative  26.57 
 
 
173 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.571735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1881  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1923  redoxin domain-containing protein  27.27 
 
 
155 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00232148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>