More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2029 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  91.2 
 
 
250 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1218  ABC transporter  61.69 
 
 
251 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4420  ABC transporter related  61.13 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686788  normal  0.324133 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3091  ABC transporter related  52.85 
 
 
249 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  43.14 
 
 
261 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0465  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
265 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  40.66 
 
 
261 aa  188  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2426  ABC transporter related  43.3 
 
 
260 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  41.6 
 
 
255 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0866  ABC transporter ATP-binding protein  38.28 
 
 
258 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.816936  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
262 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  35.94 
 
 
262 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 
262 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  40.23 
 
 
261 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4769  ABC transporter related  37.94 
 
 
253 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.530136  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  34.66 
 
 
266 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  39.61 
 
 
258 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1098  ABC transporter related  33.2 
 
 
263 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7103  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  35.34 
 
 
276 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3221  ABC transporter-related protein  34.77 
 
 
262 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  35.55 
 
 
266 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
266 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1642  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  38.49 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.44 
 
 
275 aa  164  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3609  ABC transporter related  34.25 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1704  iron  36.44 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.694973  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2698  ABC transporter related  35.97 
 
 
273 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.507313  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0574  ABC transporter related  38.17 
 
 
257 aa  161  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  36.36 
 
 
260 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
250 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0898  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
258 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  40.58 
 
 
268 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  36.11 
 
 
258 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0921  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
258 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.386488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0807  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
259 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0606817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  36.47 
 
 
254 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0835  ABC transporter ATP-binding protein  38.04 
 
 
258 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  39.35 
 
 
274 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.6 
 
 
274 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 
255 aa  152  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  42.79 
 
 
261 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0746  ABC transporter related  38.89 
 
 
258 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.260644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  36.52 
 
 
250 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  38.99 
 
 
254 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  35.65 
 
 
252 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3902  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 
270 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  37.92 
 
 
262 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
255 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  32.93 
 
 
262 aa  148  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0221  ABC transporter related  35.19 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  36.33 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 
270 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  32.4 
 
 
270 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0246  ABC transporter related  35.47 
 
 
256 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.067691  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
270 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  34.22 
 
 
260 aa  144  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  32.8 
 
 
270 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1619  ABC transporter related  34.39 
 
 
279 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  36.75 
 
 
262 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0027  ABC transporter related  37.32 
 
 
264 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1651  ABC transporter-related protein  34.3 
 
 
276 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  33.8 
 
 
253 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1575  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.04 
 
 
261 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2718  ABC transporter related  35.04 
 
 
261 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.083198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  33.33 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2633  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  35.04 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  33.8 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  39.23 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.78 
 
 
259 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
278 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  31.15 
 
 
418 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  34.63 
 
 
252 aa  138  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0757  ABC transporter related  33.47 
 
 
258 aa  137  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00138491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  33.19 
 
 
269 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1624  ATPase  39.71 
 
 
250 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.215797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 
272 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  37.61 
 
 
253 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
250 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4263  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4111  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4595  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 
272 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0733  ABC transporter related  35.62 
 
 
258 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000120086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  38.91 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4486  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  36.78 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  33.48 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4100  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
272 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  34.4 
 
 
260 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.226546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>