298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1218 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 422 aa  838    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  61.17 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  57.78 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  57.21 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  59.32 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  58.41 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  52.45 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  54.16 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  55.1 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  55.34 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  55.02 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  55.66 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  53.83 
 
 		 428 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  52.81 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  51.65 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  52.02 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  51.23 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  54.46 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  51.9 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  54.01 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  54.01 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  53.17 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  50.24 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  51.11 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  49.14 
 
 		 450 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  49.27 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  46.91 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  47.16 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  47.16 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  48.66 
 
 		 487 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  48.66 
 
 		 484 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  51.11 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  45.94 
 
 		 434 aa  346  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  51.54 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  51.34 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  51.34 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  46.4 
 
 		 379 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  45.91 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  39.8 
 
 		 420 aa  292  9e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  43.03 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  41.56 
 
 		 438 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  38.75 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  41.22 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.05 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  29.9 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  31.73 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.31 
 
 		 408 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.07 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  29.95 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  28.33 
 
 		 438 aa  150  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.85 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  27.9 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.31 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.72 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  30.3 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  29.1 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  27.58 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  26.84 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  26.73 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  25.92 
 
 		 544 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  27.75 
 
 		 448 aa  103  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  27.1 
 
 		 438 aa  103  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  26.37 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.76 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  26.37 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.76 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.76 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  26.37 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  26.26 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  28.1 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  29.23 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  25.88 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 		 391 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  25.32 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  28.3 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  28.25 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  28.25 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  28.64 
 
 		 554 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.67 
 
 		 412 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  27.01 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  27.62 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  26.83 
 
 		 542 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  25.18 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  25.42 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  26.77 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  25.83 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.37 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  27.4 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  27.4 
 
 		 456 aa  93.2  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  27.49 
 
 		 432 aa  93.2  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.8 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.97 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  25.18 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.81 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>