95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6271 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6271  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0047  protein of unknown function DUF861, cupin_3  48.7 
 
 
119 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6100  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.52 
 
 
114 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  0.927165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4304  protein of unknown function DUF861 cupin_3  44.44 
 
 
113 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.631594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1483  hypothetical protein  36.52 
 
 
114 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171215  hitchhiker  0.000969806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6574  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.52 
 
 
114 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.647379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19750  hypothetical protein  39.66 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0918  protein of unknown function DUF861 cupin_3  43.59 
 
 
113 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0754701  normal  0.435909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1701  hypothetical protein  38.79 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0904  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.12 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7582  normal  0.40632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0874  hypothetical protein  44.12 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0771767  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  38.78 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0766  hypothetical protein  33.91 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.877225  normal  0.182245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2676  hypothetical protein  39.32 
 
 
114 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0142789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.03 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.28 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.919827  normal  0.384238 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7677  hypothetical protein  38.46 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207566  normal  0.173721 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4423  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.16 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728084  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0868  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.03 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.470118  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3842  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.656555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2907  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.84 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6071  protein of unknown function DUF861, cupin_3  36.36 
 
 
126 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.045392  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3449  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.31 
 
 
113 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  37.5 
 
 
117 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4595  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0443354 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5674  hypothetical protein  38.89 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  30.3 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0909  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.5 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5906  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.33 
 
 
244 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892594  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4966  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.25 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0418481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0621  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.29 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.29 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1650  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.95 
 
 
239 aa  47.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.350548  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7526  hypothetical protein  32.84 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190702  normal  0.789293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4028  hypothetical protein  34.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  30.3 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0807  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0796  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.38 
 
 
170 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0290  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
227 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0771  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356795  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5714  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.71 
 
 
116 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0360  hypothetical protein  33.82 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4660  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.894659  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0453  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0932  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4529  protein of unknown function DUF861, cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241247  normal  0.339292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2491  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2281  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.309355  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6063  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.23 
 
 
244 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4665  hypothetical protein  34.33 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.777876  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0856  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.33 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6271  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.95 
 
 
244 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0934  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.92 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0150231  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1330  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0236  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.33 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6360  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.97 
 
 
244 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6090  hypothetical protein  32.86 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3096  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.25 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966058  normal  0.459198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4603  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.988536  normal  0.0542414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0226  hypothetical protein  28.99 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1755  hypothetical protein  29.87 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6438  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.95 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5064  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.31 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.174763 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0401  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.87 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1243  protein of unknown function DUF861 cupin_3  33.82 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6673  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.95 
 
 
260 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376834  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0091  hypothetical protein  28.99 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70170  hypothetical protein  31.43 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2474  hypothetical protein  31.34 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28380  hypothetical protein  31.34 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2651  hypothetical protein  29.41 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000014442  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2618  protein of unknown function DUF861 cupin_3  31.88 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.813991  normal  0.532352 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5000  protein of unknown function DUF861 cupin_3  35.62 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.883571  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4422  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.41 
 
 
236 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1112  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.47 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5331  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.99 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0042  hypothetical protein  35.06 
 
 
120 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.358454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5189  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.99 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322269  normal  0.130139 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.05 
 
 
87 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0992  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.86 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.347721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0974  protein of unknown function DUF861, cupin_3  32.86 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.86 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5279  hypothetical protein  28.99 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5535  hypothetical protein  30.88 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.110951  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0634  protein of unknown function DUF861 cupin_3  30.3 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491778  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0191  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.99 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0614  protein of unknown function DUF861, cupin_3  27.94 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0964  protein of unknown function DUF861, cupin_3  28.99 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.179543  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0161  hypothetical protein  26.47 
 
 
237 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191842  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3163  protein of unknown function DUF861, cupin_3  29.85 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230079  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2929  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.43 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000538599  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3011  protein of unknown function DUF861, cupin_3  30.43 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>