286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3481 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
136 aa  265  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  72.79 
 
 
138 aa  191  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3236  holo-acyl-carrier-protein synthase  49.26 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.209642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.24 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  48.82 
 
 
126 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0445  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  46.77 
 
 
119 aa  104  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_387  holo-(acyl-carrier protein) synthase  45.97 
 
 
119 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0422  holo-acyl-carrier-protein synthase  44.35 
 
 
119 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1313  holo-acyl-carrier-protein synthase  51.59 
 
 
127 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  40.16 
 
 
125 aa  98.2  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  44 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  45.38 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.46 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.32 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.42 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.23 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1885  phosphopantetheinyl transferase (holo-ACP synthase)  41.27 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0607  holo-acyl-carrier-protein synthase  47.24 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.636009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.34 
 
 
123 aa  84.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.34 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.41 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  44.26 
 
 
125 aa  84  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1884  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
126 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00133068  hitchhiker  0.0000000924869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3772  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.03 
 
 
132 aa  83.6  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1014  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.52 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1803  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.6 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.8 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.91 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4464  holo-acyl-carrier-protein synthase  43.51 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.01 
 
 
125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.84 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1701  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.58 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.092305  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26690  phosphopantethiene--protein transferase  40 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0312037  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.52 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  39.84 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1876  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.37 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09407  Fatty acid synthase, alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78615]  38.21 
 
 
1860 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00116938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4249  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.73 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3859  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.73 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.89 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.16 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4518  4'-phosphopantetheinyl transferase  43.09 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.67 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.68 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80966  Fatty acid synthase subunit alpha Includes: Acyl carrier 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (Beta-ketoacyl reductase) 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase (Beta-ketoacyl synthase)  34.96 
 
 
1880 aa  74.7  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.507554  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.58 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.34 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.72 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  36 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1021  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.21 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.37 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1340  holo-acyl-carrier-protein synthase  40.83 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0725  holo-acyl-carrier-protein synthase  41.27 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00593002  normal  0.202628 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.15 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2561  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.11 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0826465  hitchhiker  0.00133765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.13 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.07 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2872  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.8 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0141678 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.7 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1596  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.75 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.21 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1408  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.75 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.22 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.43 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1188  holo-acyl-carrier-protein synthase  39.06 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.884581 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.75 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0910  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.84 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.123899  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0680  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.56 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.07 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2044  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.5 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0903  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.06 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  42.52 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  36.89 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1247  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.05 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.68 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0271  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.62 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0520  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.92 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3872  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.85 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798491  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1668  holo-acyl-carrier-protein synthase  31.78 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1907  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.2 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2272  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.82 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.34 
 
 
114 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0568  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.4 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3879  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.3 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.216997 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2547  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.88 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  0.0384272 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0878  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.45 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0696811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.07 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.82 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1572  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.56 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.335849  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  34.62 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>