240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0878 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0878  holo-acyl-carrier-protein synthase  100 
 
 
124 aa  254  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0696811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1319  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.1 
 
 
114 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0839  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.75 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1391  4'-phosphopantetheinyl transferase  53.98 
 
 
114 aa  124  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1742  4'-phosphopantetheinyl transferase  52.68 
 
 
115 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1408  4'-phosphopantetheinyl transferase  51.79 
 
 
115 aa  120  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1596  4'-phosphopantetheinyl transferase  50.89 
 
 
115 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  45.61 
 
 
115 aa  114  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  46.49 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1428  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  47.15 
 
 
124 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1107  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.82 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.454224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0961  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0250  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 
123 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1045  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.935838  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01660  Holo-(acyl-carrier-protein) synthase  35.83 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1096  holo-acyl-carrier-protein synthase  35.54 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0470  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.33 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1255  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.13 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0376  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.04 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2138  holo-acyl-carrier-protein synthase  37.07 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.75 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.332386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0361  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.77 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0235  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.44 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03532  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.83 
 
 
126 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1760  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.5 
 
 
126 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2565  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.98 
 
 
120 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2548  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3481  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.61 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.870655  normal  0.0327725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1283  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  34.96 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.329256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2169  phosphopantethiene-protein transferase domain-contain protein  28 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000567613  hitchhiker  0.000188927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2521  4'-phosphopantetheinyl transferase  35 
 
 
126 aa  60.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.280431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002501  holo-[acyl-carrier protein] synthase  35.83 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1859  holo-acyl-carrier-protein synthase  33.07 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204233  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0884  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.45 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.331575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1208  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.66 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0218  holo-acyl-carrier-protein synthase  38.66 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.299586  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1906  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.17 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2868  holo-acyl-carrier-protein synthase  36.07 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2033  Holo-acyl carrier protein synthase:phosphopantethiene-protein transferase  31.09 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.20523  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0278  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  28.89 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0287  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.66 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1089  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.13 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2167  holo-acyl-carrier-protein synthase  29.75 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2035  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.5 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0030  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.58 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1760  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.67 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1003  apo-(acyl-carrier-protein) pantetheinephosphotransferase  34.96 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00165358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2322  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.52 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000018743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3023  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.41 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0270  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0284  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0262  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0236  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0222  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0224  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0977  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.79 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000420357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1673  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0738  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  31.67 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0250  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.88 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1260  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.57 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0228  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2209  holo-acyl-carrier-protein synthase  34.4 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.870664  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0306  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2573  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0256708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02457  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1105  holo-acyl-carrier-protein synthase  30 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.331177  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0326  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000137986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02421  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0300  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.77 
 
 
125 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00231952  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1114  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0282  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.11 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3665  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.93 
 
 
126 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0741  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.77 
 
 
123 aa  53.9  0.0000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.125291  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0909  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.29 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00194356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1249  holo-acyl-carrier-protein synthase  32.23 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3050  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.33 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0986537  normal  0.022176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2527  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0265  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.73 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.771008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0198  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.71 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5060  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
119 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1072  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.93 
 
 
126 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.549498  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1404  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  30.08 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1125  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.08 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.617257  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2308  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.58 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0208119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2849  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.575353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1140  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3615  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1193  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04710  phosphopantethiene--protein transferase  33.08 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.282871  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2716  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2928  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.768725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1384  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.08 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0996  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.638191  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3799  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2781  4'-phosphopantetheinyl transferase  30 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0932  holo-acyl-carrier-protein synthase  30.7 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3067  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.5 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0208  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.17 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0873821  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2718  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.17 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0801  holo-(acyl-carrier-protein) synthase  30.83 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>