More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1084 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1084  major facilitator transporter  100 
 
 		 469 aa  889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.471807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  78.62 
 
 		 461 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1216  major facilitator transporter  43.87 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0290926  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4819  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4090  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  36.09 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6047  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6463  MFS transporter  41.06 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0361  multidrug resistance efflux protein  33.63 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.26743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3895  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 483 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373107  hitchhiker  0.00809284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1560  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.64499  hitchhiker  0.00932539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0209  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0739  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26390  arabinose efflux permease family protein  34.46 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.095972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0925  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 445 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0793679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3501  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 461 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0294154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08610  arabinose efflux permease family protein  35.21 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20420  arabinose efflux permease family protein  38.26 
 
 		 492 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3774  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3939  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116564  hitchhiker  0.00194225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 		 500 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.95 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 548 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1223  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 489 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.13 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 486 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 491 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 491 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.09 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.08 
 
 		 538 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.5 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2387  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 511 aa  113  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2605  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.34 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1278  major facilitator superfamily protein superfamily  28.78 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0634379  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2100  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.88 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.44 
 
 		 538 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 523 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  27.74 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1623  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.374459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.35 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 		 487 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  40 
 
 		 481 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.65 
 
 		 539 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 500 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  26.38 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  26.38 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  26.38 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1220  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 450 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 495 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  26.14 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  26.38 
 
 		 537 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.12 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.12 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.3 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.12 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.06 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  25.9 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0436  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  26.38 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.12 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.12 
 
 		 513 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1591  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.06 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.88 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.59 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0727  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 476 aa  103  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.9 
 
 		 517 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.96 
 
 		 537 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.96 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4933  transport transmembrane protein  28.22 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.53 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.83 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1959  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.789773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.71 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.3 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0895  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.915282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 243 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  26.24 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0541  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 549 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 539 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 495 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  25.83 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>