More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0215 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0215  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  547  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.52 
 
 		 277 aa  343  1e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18450  short chain dehydrogenase  58.67 
 
 		 279 aa  324  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1001  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 		 301 aa  301  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4340  short chain dehydrogenase  48.71 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0293254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3000  short chain dehydrogenase  47.99 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0641388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 278 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.22 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  28.78 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1577  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.458261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  27.78 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  28.36 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0113  acetoin reductase  27.68 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0117  acetoin reductase  27.68 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  28.88 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01006  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  28.63 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  27.86 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.47 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.49 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.18 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  27.41 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.36 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  28.26 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  29.14 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  27.68 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  29.95 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4068  short chain dehydrogenase  27.7 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  26.57 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  29.5 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  27.9 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 		 251 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1400  short chain dehydrogenase  31.34 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0683679  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.58 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.264483  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  26.94 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  26.94 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  26.94 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  26.89 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  25.44 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  28 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.28 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206497 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1800  short chain dehydrogenase  28.79 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  27.5 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.218864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1629  short chain dehydrogenase  29.14 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1364  putative glucose/ribitol dehydrogenase  29.2 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.333439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.959898  normal  0.356317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  27.84 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.165575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.37 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>