278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2587 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  100 
 
 		 286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  99.65 
 
 		 292 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  93.01 
 
 		 286 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  80.75 
 
 		 272 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  70.59 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  68.95 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  66.67 
 
 		 293 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  69.74 
 
 		 281 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  71.54 
 
 		 284 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  69.49 
 
 		 297 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  69.12 
 
 		 297 aa  362  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  69.42 
 
 		 290 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  67.63 
 
 		 292 aa  358  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  66.91 
 
 		 297 aa  344  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  69.06 
 
 		 267 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  66.54 
 
 		 263 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  68.66 
 
 		 277 aa  334  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  64.71 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  62.21 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  58.85 
 
 		 270 aa  296  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  61.83 
 
 		 263 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  60.31 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  59.58 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  58.27 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  57.89 
 
 		 260 aa  265  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1945  ABC-2 type transporter  61.81 
 
 		 263 aa  257  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0850168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  56.39 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  54.55 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  53.97 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4979  ABC-2 type transporter  55.51 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  56.76 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  53.23 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  33.94 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  32.16 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.19 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.22 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.8 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  31.67 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  29.75 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.03 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.05 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.27 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.39 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.94 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.94 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  27.76 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.44 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.68 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  27.06 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.29 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  30.38 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.23 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.06 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.79 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  24.46 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  31.28 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.56 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  25.79 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.73 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  27.49 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.23 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  30.45 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>