More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1309 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
239 aa  460  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  99.16 
 
 
238 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  84.55 
 
 
236 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 
248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  70.4 
 
 
243 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  66.08 
 
 
242 aa  291  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  62.11 
 
 
241 aa  270  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  48.74 
 
 
248 aa  234  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  51.04 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  50.21 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  53.64 
 
 
234 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  51.75 
 
 
253 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  52.86 
 
 
254 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  52.73 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  52.25 
 
 
251 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  52.73 
 
 
283 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  49.36 
 
 
254 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
266 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  48.65 
 
 
251 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  51.58 
 
 
253 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  51.36 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  51.57 
 
 
255 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  47.81 
 
 
245 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  52.44 
 
 
266 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  47.21 
 
 
246 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  47.73 
 
 
253 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
260 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
260 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  46.95 
 
 
253 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  50.89 
 
 
264 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  47.42 
 
 
262 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  47.44 
 
 
247 aa  202  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  43.27 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  45.65 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  45.65 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  45.65 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  42.98 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  42.21 
 
 
245 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  42.21 
 
 
245 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  46.45 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
253 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  45.25 
 
 
248 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  47.14 
 
 
265 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  48.13 
 
 
253 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0030  flagellar biosynthesis protein FliP  46.92 
 
 
276 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  47.62 
 
 
264 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  46.45 
 
 
253 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
289 aa  191  9e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.45 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
281 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  41.39 
 
 
245 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  46.45 
 
 
276 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 
248 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
247 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
248 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
253 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  44.6 
 
 
262 aa  188  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
250 aa  188  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  45.02 
 
 
253 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  43.13 
 
 
299 aa  187  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.38 
 
 
244 aa  187  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.38 
 
 
244 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  42.52 
 
 
248 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
277 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0155  flagellar biosynthesis protein FliP  45.97 
 
 
279 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.552486 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.55 
 
 
253 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  42.68 
 
 
257 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  43.81 
 
 
289 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  42.92 
 
 
244 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  42.15 
 
 
244 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  45.54 
 
 
251 aa  185  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  48.84 
 
 
248 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1984  flagellar biosynthesis protein FliP  41.84 
 
 
253 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0245  flagellar biosynthesis protein FliP  43.28 
 
 
250 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  43.84 
 
 
252 aa  184  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  41.31 
 
 
249 aa  184  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3387  flagellar biosynthesis protein FliP  43.28 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  41.87 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3797  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3071  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  44.98 
 
 
250 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  47.89 
 
 
262 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  45.37 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.07 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  39.25 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  40.87 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  42.47 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  43.17 
 
 
249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  45.91 
 
 
262 aa  181  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  43.19 
 
 
280 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  43.46 
 
 
251 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>