More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1106 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  74.85 
 
 		 173 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  47.85 
 
 		 185 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  48.41 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.47 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  46.39 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  47.47 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.59 
 
 		 189 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.1 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  48.67 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  41.72 
 
 		 191 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  41.18 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  39.87 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  40.38 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  41.5 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  43.8 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  39.04 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 		 162 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  48.3 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  38 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  39.33 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  36.31 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  36.31 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  36.71 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  38.1 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.38 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  36.73 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  35.71 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.33 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  35.29 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  38.16 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.18 
 
 		 374 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.69 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  36.59 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  33.73 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  38.82 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  35.76 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  34.67 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.08 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.68 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  39.07 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.07 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  37.74 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  34.67 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  33.33 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  33.97 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  32.28 
 
 		 171 aa  100  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  31.79 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  39.6 
 
 		 226 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.72 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.91 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.13 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  34.19 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.31 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.95 
 
 		 259 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  30.38 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.78 
 
 		 159 aa  98.2  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  38.93 
 
 		 228 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 226 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  36.97 
 
 		 226 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.67 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 226 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  37.97 
 
 		 226 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  38.93 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.33 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.65 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 171 aa  94.4  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  33.95 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  34.83 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.77 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  30.67 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.49 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.44 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  30 
 
 		 164 aa  90.9  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  37.25 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.53 
 
 		 408 aa  89.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.67 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.64 
 
 		 430 aa  87.8  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.33 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  33.56 
 
 		 180 aa  87.4  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.67 
 
 		 165 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  29.33 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  28.12 
 
 		 170 aa  87.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>